[发明专利]一种浒苔种群的线粒体分子标记引物及其应用有效
申请号: | 201810305129.1 | 申请日: | 2018-04-08 |
公开(公告)号: | CN108315468B | 公开(公告)日: | 2021-07-27 |
发明(设计)人: | 高大海;孙忠民;黄超华 | 申请(专利权)人: | 中国科学院海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 李颖;周秀梅 |
地址: | 266071 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 种群 线粒体 分子 标记 引物 及其 应用 | ||
1.一种用于鉴定漂浮型浒苔和定生型浒苔的引物,特征在于:所述引物为:
上游引物序列:5'AAAATCAAAATCTAGTAAACCAGGC3',
下游引物序列:5'GCTAGCGATTCTTAACGCGATTGGG3’。
2.权利要求1所述引物在鉴别漂浮型浒苔和定生型浒苔中的应用。
3.一种用于鉴定漂浮型浒苔和定生型浒苔的方法,其特征在于:
1)以待测样品的DNA为模板,用权利要求1所述的引物,进行PCR扩增;
2)将上述扩增获得产物经电泳检测,将电泳检测中在500bp左右存在条带的样品进一步测序分析,获得样品线粒体rps2-trnL基因间片段;
3)将所述rps2-trnL基因间片段与浒苔种群标准参考序列SEQ ID 3- SEQ ID 9进行碱基序列全局对比,截取比对矩阵前后同源性后,使用系统发育软件进行邻接法系统发育分析,根据系统发育树的结果继而实现高分辨率的鉴别浒苔种群;
4)若所述待测样品的序列与漂浮生态型浒苔标准参考序列SEQ ID 3在同一系统发育枝上,则此样品与已知漂浮生态型浒苔具有一致或相似的基因型,即待测样品为漂浮生态型浒苔;若所述待测样品的序列与定生型浒苔标准参考序列SEQ ID 4- SEQ ID 9在同一系统发育枝上,则此样品与已知定生型浒苔具有一致或相似的基因型,即待测样品为定生型浒苔。
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