[发明专利]检测马铃薯M病毒用的引物、试剂盒及方法在审
申请号: | 201810317468.1 | 申请日: | 2018-04-10 |
公开(公告)号: | CN108300810A | 公开(公告)日: | 2018-07-20 |
发明(设计)人: | 陈定虎 | 申请(专利权)人: | 陈定虎 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 中山市兴华粤专利代理有限公司 44345 | 代理人: | 吴剑锋 |
地址: | 528400*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物 马铃薯M病毒 试剂盒 马铃薯X病毒 特异性强 灵敏性 种检测 检测 | ||
1.一种检测马铃薯M病毒用的引物,其特征在于包括:
PVM-F3:5’-TATGAGGACCGGTTCGCC-3’
PVM-B3:5’-GACCATTCATACCGCCAGTC-3’
PVM-FIP:5’-CGGGGTTGGTCGCCTTATCAG-TTACGTGGAGAACACTGCTG-3’
PVM-BIP:5’-AAGGACGTGGCTTTACGTGGT-ACCTCGGCATTAAGAGAGCT-3’。
2.一种检测马铃薯M病毒用的试剂盒,其特征在于该试剂盒包括有:
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于所述的2×反应液缓冲液由以下组分组成:
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于所述的酶溶液为Bst DNA聚合酶和AMV逆转录酶混合液。
5.根据权利要求2至4所述的任一种试剂盒,其特征在于荧光目视检测试剂中含有钙黄绿素荧光染料。
6.一种马铃薯M病毒检测方法,其特征在于包括以下步骤:
A、植物组织总DNA提取;
B、LAMP检测:
采用权利要求2所述的试剂盒配置预反应溶液,在预反应溶液中分别加入待检测的样品的DNA 5μL,使总量达到25μL;其中对照组在预反应溶液加入去离子水5μL;阳性对照在预反应溶液中加入带病毒的DNA 5μL;用移液器吸排液法混合,或者合上盖子轻击使溶液充分混合后瞬时离心,混合时避免产生气泡;将混合物置于反应孔中,于65℃恒温反应90min,最后80℃下保温5min以结束反应;
C、LAMP结果判断
扩增反应结束后,使用紫外线照射装置,波长240-260nm,350-370nm,从反应试管底部向上进行紫外线照射,佩戴眼镜等防护用具后从反应试管侧面进行观察,若与阳性对照一样发出绿色荧光,则判定为阳性即样品中带有马铃薯M病毒;若与阴性对照一样未发出绿色荧光,则判定样品中没有携带马铃薯M病毒。
7.根据权利要求6所述的检测方法,其特征在于步骤A中植物组织总DNA提取的具体步骤:
a制样:取0.5g的带毒组织加入1mL抽提缓冲液进行研磨;
b清洗纳米磁珠:取出免疫纳米磁珠到PCR管中,用ddH2O反复清洗纳米磁珠3次,在磁铁的作用下吸去ddH2O;
c结合:加入100μL的样品到PCR管中,用移液枪吸吐混匀样品和纳米磁珠,室温下吸附;
d清洗:在磁铁的作用下移去上清,纳米磁珠清洗3次;
e裂解:加入50μL ddH2O到PCR管中,用移液枪吸吐混匀纳米磁珠后,95℃,10min;
f取样:用磁铁吸附纳米磁珠,待PCR管内溶液澄清后,上清即为病毒RNA;
g核酸浓度的测定
取5μL DNA溶液加ddH2O梯度稀释至1mL,使用核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计测260nm和280nm处的光密度值;RNA的浓度按照以下公式计算获得:
RNA C=40×N×A
式中:
C——RNA浓度(ng/μL)
A——260nm处的吸光值
N——核酸稀释倍数
1OD260nm=40μg/mL单链RNA
当OD260/OD280比值在1.7~1.9之间时,适宜于PCR扩增和LAMP检测。
8.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于所述纳米磁珠通过以下方法制备:
1)Fe3O4磁性纳米粒子制备与氨基化修饰
分别取5.2g FeCl3·6H2O、2.7g FeSO4·7H2O、0.85mL 12.1moL/L的浓盐酸溶解于200mL水中,超声脱氧,后将以上溶液滴入250mL、0.75moL/L NaOH溶液;所有反应在80℃下搅拌,随着反应的进行,反应液中出现黑色的沉淀,反应结束后,利用磁分离器将所得沉淀从反应介质中分离出来,再用去离子水清洗3次,无水乙醇清洗2次,并配成5g/mL的Fe3O4磁性纳米粒子无水乙醇溶液,取25mL Fe3O4磁性纳米粒子无水乙醇溶液,再用无水乙醇稀释到150mL,超声振荡30min,滴加0.4mL APTES,其中硅烷偶联剂:3-氨基丙基三乙氧基硅烷,室温下搅拌7h,反应完毕,用磁分离器将APTES修饰的Fe3O4磁性纳米粒子从反应介质中分离,并用无水乙醇溶液清洗3次,最后配成10.5mg/mL的氨基化Fe3O4纳米磁珠无水乙醇溶液;
2)免疫磁珠的制备
取0.5mL氨基化Fe3O4纳米磁珠无水乙醇溶液,用1mL PBS清洗3次,磁分离器弃上清液,加入5%(V/V)戊二醛溶液2mL,室温振荡交联2h,磁分离,弃上清液,用PBS洗涤3次并弃上清液后,分别采用0.5mL不同稀释倍数的相应病毒抗体包被氨基化Fe3O4纳米粒子,室温下振荡固定2h,磁分离,用PBS和超纯水分别洗涤3次,再用PBS定容,4℃冰箱保存备用,到具有最佳吸附量的一病毒抗体免疫磁珠。
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