[发明专利]一种萌发初期的羊草种子RNA提取方法在审

专利信息
申请号: 201810319326.9 申请日: 2018-03-31
公开(公告)号: CN108277218A 公开(公告)日: 2018-07-13
发明(设计)人: 孔令琪;叶文兴;任卫波;王照兰;武自念 申请(专利权)人: 中国农业科学院草原研究所;文县农牧局
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 010010 内蒙古自治区呼和浩特市*** 国省代码: 内蒙古;15
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摘要:
搜索关键词: 羊草种子 抽提 分子生物学研究 提取缓冲液 操作过程 多糖物质 酚类物质 溶液分层 巯基乙醇 蛋白酶K 饱和酚 低成本 冻干粉 高纯度 高效率 提取液 异戊醇 试管 氯仿 淀粉 去除 蛋白质 溶解 清晰
【权利要求书】:

1.一种萌发初期的羊草种子RNA提取方法,其特征在于:所述羊草种子RNA提取方法选用提取缓冲液A将含有多聚聚乙烯比咯烷酮PVPP的羊草种子冻干粉溶解,加入聚乙烯吡咯烷酮PVP、乙基苯基聚乙二醇NP-40和蛋白酶K,经水饱和酚+氯仿+异戊醇抽提,用Trizol提取方法再次抽提,最终得到高质量、高纯度的羊草种子RNA。

2.根据权利要求1所述的一种萌发初期的羊草种子RNA提取方法,其特征在于:所述羊草种子RNA提取方法的具体操作步骤如下:

(1)取0.5g萌发三天时的羊草种子放入加有液氮的研钵中,加入0.05gPVPP,迅速研磨成粉;

(2)将含有PVPP的冻干粉末混匀,加入到2ml干净的离心管至0.5ml处,加入500μl提取缓冲液A,旋涡振荡混匀30s,加入质量浓度为2%的PVP、10μl NP-40和50μl质量浓度为20mg/ml的蛋白酶K,旋涡振荡2min,置于42℃摇床中以150r/min的速度摇动30min;

(3)加入0.5ml预冷的水饱和酚+氯仿+异戊醇,水饱和酚∶氯仿∶异戊醇=49∶49∶2,颠倒振荡3~5min,使两项充分混合,在室温条件下静置5min,4℃、12000g离心5min;

(4)使用Trizol提取方法抽提:取0.5ml上清液至2ml新的干净离心管中,加入1ml的Trizol提取液B,加入质量浓度为1%的β-巯基乙醇,旋涡振荡1min,加入0.2ml氯仿,颠倒振荡3min,4℃、12000g离心5min;

(5)取1ml上清液至新的干净离心管中,加入1ml预冷的异丙醇,在室温条件下放置15min,4℃、12000g离心15min;

(6)小心弃去上清液,加入1ml预冷的质量浓度为75%的乙醇,轻轻颠倒摇动以悬浮洗涤沉淀,冰上放置2min,4℃、10000g离心5min;

(7)重复上述(6)步骤;将空管4℃、10000g离心2min,小心的吸干余液,在室温条件下干燥3~5min,加入50ul RNase-free ddH2O溶解沉淀即得羊草种子RNA。

3.根据权利要求2所述的一种萌发初期的羊草种子RNA提取方法,其特征在于:所述步骤(2)中的提取缓冲液A的配制,如配制10ml提取缓冲液A:包括7ml RNase-free ddH2O、0.5ml摩尔浓度为1mol/L、pH=9的Tris、1ml摩尔浓度为2mol/L的NaCl、1ml质量浓度为10%的十二烷基硫酸钠SDS、0.4ml摩尔浓度为0.5mol/L的乙二胺四乙酸EDTA、1ml摩尔浓度为1mol/L的二硫苏糖DTT。

4.根据权利要求2所述的一种萌发初期的羊草种子RNA提取方法,其特征在于:所述步骤(4)中Trizol提取液B的配制体系,如配制100ml的Trizol提取液B:包括47.27g摩尔浓度为4mol/L的异硫氰酸胍、0.681g摩尔浓度为0.05mol/L的NaAc·3H2O、5.83g摩尔浓度为1mol/L的NaCl、0.5g质量浓度为5%的SDS、0.745g摩尔浓度为0.02mol/L的EDTA·2H2O,由RNase-free ddH2O溶解后,加入等体积的水饱和酚,用冰醋酸调节pH值在4.2~4.3之间。

5.根据权利要求2所述的一种萌发初期的羊草种子RNA提取方法,其特征在于:所述步骤(6)中质量浓度为75%的乙醇由无水乙醇和RNase-free ddH2O配制,所述RNase-freeddH2O是经过焦碳酸二乙醇DEPC处理的高温高压灭菌的超纯水。

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