[发明专利]基于CRISPR-链取代的等温扩增及检测技术在审
申请号: | 201810328785.3 | 申请日: | 2018-04-13 |
公开(公告)号: | CN108588182A | 公开(公告)日: | 2018-09-28 |
发明(设计)人: | 喻学锋;周文华;胡丽 | 申请(专利权)人: | 中国科学院深圳先进技术研究院 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 许飞 |
地址: | 518055 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 等温扩增 检测技术 试剂盒 等温扩增反应 目标DNA序列 抗干扰能力 特异性识别 单链区域 技术操作 检测结果 扩增引物 目的基因 复合体 核酸酶 切口酶 野生型 引物 暴露 | ||
1.一种基于CRISPR-链取代的等温扩增试剂盒,包括链取代等温扩增试剂,其特征在于:试剂盒还包括了野生型Cas9和/或核酸酶缺陷的Cas9切口酶、特异性识别目标DNA序列上下游的sgRNA对,链取代等温扩增反应的扩增引物对,该引物对与Cas9-sgRNA复合体对与目的基因结合后暴露出的单链区域互补。
2.根据权利要求1所述的等温扩增试剂盒,其特征在于:核酸酶缺陷的Cas9切口酶为HNH核酸酶缺陷的Cas9切口酶。
3.根据权利要求1所述的等温扩增试剂盒,其特征在于:sgRNA对的识别位点分别为目的序列上游CCN序列3’端的10~30个核苷酸序列和下游NGG序列5’端的10~30个核苷酸序列。
4.根据权利要求1所述的等温扩增试剂盒,其特征在于:链取代等温扩增试剂的DNA引物具有如下特征:该引物5’端包含了一个切口酶识别位点,且该位点的酶切位点在其互补链上;该引物的中段与Cas-sgRNA复合体所识别的靶DNA区域的NGG序列所在链的至少10个连续核苷酸互补配对。
5.根据权利要求4所述的等温扩增试剂盒,其特征在于:链取代等温扩增试剂的DNA引物的3’端包含了一段1~10个核苷酸的与NGG序列所在链核苷酸互补的序列。
6.根据权利要求1所述的等温扩增试剂盒,其特征在于:sgRNA对识别位点的间距100~1000bp,优选100~250bp,识别位点5’端以CCN为起点,3’端靶序列以NGG为终点。
7.一种基于CRISPR-链取代的核酸检测试剂盒,其特征在于:包括权利要求1~6任一项所述的等温扩增试剂盒,以及核酸定量分析试剂。
8.根据权利要求7所述的核酸检测试剂盒,其特征在于:核酸定量分析试剂选自特异性分子信标分子。
9.基于CRISPR-链取代的等温扩增方法,包括如下步骤:
1)获取待测样品核酸;
2)使用权利要求1~6任一项等温扩增试剂盒含有的试剂对待测核酸样品进行扩增。
10.基于CRISPR-链取代的等温扩增检测方法,包括如下步骤:
1)获取待测样品核酸;
2)使用权利要求1~6任一项等温扩增试剂盒含有的试剂对待测核酸样品进行扩增;
3)对扩增产物进行分析,确定检测结果。
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