[发明专利]用于MSTN基因敲除猪鉴定的功能核酸快速PCR方法与试剂盒在审
申请号: | 201810421781.X | 申请日: | 2018-05-04 |
公开(公告)号: | CN108660195A | 公开(公告)日: | 2018-10-16 |
发明(设计)人: | 刘榜;苏秋菊;周翔;王文君;付明 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12Q1/6888 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 张红兵 |
地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 敲除 试剂盒 条带 判定 功能核酸 扩增片段 快速PCR 转基因成分检测 等位基因扩增 特异性片段 转基因生物 基因敲除 扩增产物 特异引物 位点设计 引物组合 野生型 杂合型 纯合 检测 配置 应用 | ||
1.一种检测MSTN基因敲除猪成分的PCR方法,其特征包括,根据基因敲除位点,设计2条不同的正向引物和一条共用的反向引物;所述的其中一条正向引物是针对野生型检测的引物,该正向引物的序列如SEQ ID NO:3所示,该引物的3′端终止于对应的敲除位点,即SEQID NO:3所示序列的第42位和第43位的AG两个碱基处;所述的另一条正向引物是针对敲除型检测的引物,该正向引物的序列如SEQ ID NO:5所示,该引物的3′端跨越敲除位点,即SEQID NO:3所示序列的第42位和第43位的AG两个碱基处后再延伸两个碱基,即SEQ ID NO:5所示序列的第22位和第23位的CT两个碱基;针对用于野生型检测的正向引物的5′端进行功能核酸接头设计,即在正向引物的5′端添加20bp的功能核酸序列,该序列是GCTTATCTATAGCATTGAAG,使野生型的引物和敲除型的引物的扩增片段大小出现差异,通过PCR扩增,使MSTN基因被敲除猪、野生型猪及其杂合子猪能扩增出不同大小的片段,实现对基因敲除猪快速简便的检测。
2.一种检测MSTN基因敲除猪成分的PCR引物,其特征包括,采用下述引物组合对目标基因进行PCR扩增:
引物组合1:
正向引物MSTN-WT-F:GCTTATCTATAGCATTGAAGCCCTCTAACTGTGGATTTTGAAG;
反向引物MSTN-R:CACCCACAGCGATCTACTACCA;
得到如序列表SEQ ID NO:1所示序列的扩增片段;
和
引物组合2:
正向引物MSTN-KO-F:CCCTCTAACTGTGGATTTTGACT;
反向引物MSTN-R:CACCCACAGCGATCTACTACCA;
得到如序列表SEQ ID NO:2所示序列的扩增片段。
3.一种检测MSTN基因敲除猪的试剂盒,其特征包括,所述的试剂盒按照如下配置:
(1)PCR引物:
正向引物MSTN-WT-F:GCTTATCTATAGCATTGAAGCCCTCTAACTGTGGATTTTGAAG;
正向引物MSTN-KO-F:CCCTCTAACTGTGGATTTTGACT;
反向引物MSTN-R:CACCCACAGCGATCTACTACCA;
(2)相关试剂:
10×PCR Buffer、dNTP Mix、Taq聚合酶、阳性对照DNA模板、阴性对照DNA模板、空白对照双蒸水;
PCR扩增后,根据所得条带对基因型进行鉴定,若能扩增出一条290bp的条带,判定为野生型;若能扩增出一条268bp的条带,判定为MSTN基因敲除的纯合型;若能同时扩增出290bp和268bp两条条带,判定为杂合型。
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