[发明专利]番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45及其克隆、检测与应用方法有效

专利信息
申请号: 201810430303.5 申请日: 2018-05-08
公开(公告)号: CN108588078B 公开(公告)日: 2021-09-10
发明(设计)人: 栾雨时;张敏 申请(专利权)人: 大连理工大学
主分类号: C12N15/113 分类号: C12N15/113;C12N15/10;C12N15/84;A01H5/00;A01H6/82
代理公司: 大连格智知识产权代理有限公司 21238 代理人: 王晨
地址: 116000 辽*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 番茄 晚疫病 外显子 环状 rna ecircrna45 及其 克隆 检测 应用 方法
【权利要求书】:

1.一种番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45,其特征在于,其序列如SEQ ID NO.1所示。

2.权利要求1所述番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45的克隆方法,其特征在于,以EcircRNA45-C-FP、EcircRNA45-C-RP和EcircRNA45-D-FP、EcircRNA45-D-RP为特异性引物,其中,EcircRNA45-C-FP和EcircRNA45-C-RP所示的DNA序列组成正向引物对,EcircRNA45-D-FP和EcircRNA45-D-RP所示的DNA序列组成反向引物对;

所述的特异性引物EcircRNA45-C-FP、EcircRNA45-C-RP、EcircRNA45-D-FP和EcircRNA45-D-RP序列分别如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5所示。

3.根据权利要求2所述番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45的克隆方法,其特征在于,以番茄L3708的gDNA和cDNA为模板,分别以EcircRNA45-C-FP、EcircRNA45-C-RP、EcircRNA45-D-FP和EcircRNA45-D-RP为特异性引物,进行PCR扩增,即可得到番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45。

4.权利要求1所述番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45表达量的检测方法,其特征在于,在番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45的反向剪接位点两端进行qRT-PCR的引物设计,设计的引物分别为qRT-EcircRNA45-FP和qRT-EcircRNA45-RP;

所述设计的引物qRT-EcircRNA45-FP和qRT-EcircRNA45-RP序列分别如SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7所示。

5.权利要求1所述番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45的应用方法,其特征在于,具体方法为:

S1、对番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45序列两端进行延长,最终在其序列的上游和下游引入反向剪接位点;

S2、根据新序列进行引物设计并在引物两端分别添加Bam H I和Sac I酶切位点与保护碱基后得到最终引物,所述最终引物为EcircRNA45-FP和EcircRNA45-RP;

EcircRNA45-FP序列如SEQ ID NO:12所示,EcircRNA45-RP序列如SEQ ID NO:13所示;

S3、用步骤S2获得的最终引物进行番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45序列扩增并连接pBI121载体,得到最终表达载体pBI121-EcircRNA45;

S4、将步骤S3制得的最终表达载体pBI121-EcircRNA45导入根癌农杆菌GV3101感受态细胞,摇菌培养,得到pBI121-EcircRNA45过表达载体菌液;

S5、取六叶期番茄作为处理对象,以注射的方式向所述六叶期番茄叶片内导入的步骤S4制得的pBI121-EcircRNA45过表达载体菌液,进而实现番茄抗晚疫病外显子环状RNA-EcircRNA45的过表达。

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