[发明专利]一种用于癌症预后的多基因检测试剂盒有效
申请号: | 201810440801.8 | 申请日: | 2018-05-10 |
公开(公告)号: | CN110468200B | 公开(公告)日: | 2023-02-28 |
发明(设计)人: | 邵宁 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 上海容慧专利代理事务所(普通合伙) 31287 | 代理人: | 于晓菁 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 癌症 预后 多基因 检测 试剂盒 | ||
1.一种用于癌症预后的多基因检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括检测MCM2、GATM、PTGDS、ETV1、CASP3、NOTCH3、WNT5A、GLIS1、TNFRSF10B、COL4A6、MMP19、MSR1、PALLD、CCNG2和TMPRSS2表达水平的检测试剂;所述癌症选自前列腺癌。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述检测试剂包括多核苷酸引物或探针。
3.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述多核苷酸引物的序列如SEQIDNO:1-30所示。
4.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述癌症预后的确定包括以下步骤:
(a)检测样本的MCM2、GATM、PTGDS、ETV1、CASP3、NOTCH3、WNT5A、GLIS1、TNFRSF10B、COL4A6、MMP19、MSR1、PALLD、CCNG2和TMPRSS2的mRNA表达水平;
(b)根据步骤(a)获得的表达水平数据评估患者的癌症复发风险;
其中步骤(b)中通过以下方法评估患者的癌症复发风险:
风险值=(0.4237×MCM2表达水平)+(0.1915×GATM表达水平)+(-0.1810×PTGDS表达水平)+(0.2629×ETV1表达水平)+(0.0140×CASP3表达水平)+(0.0802×NOTCH3表达水平)+(0.1480×WNT5A表达水平)+(-0.0775×GLIS1表达水平)+(-0.4323×TNFRSF10B表达水平)+(-0.0318×COL4A6表达水平)+(-0.4802×MMP19表达水平)+(0.0775×MSR1表达水平)+(0.0650×PALLD表达水平)+(0.0254×CCNG2表达水平)+(0.0106×TMPRSS2表达水平)。
5.检测MCM2、GATM、PTGDS、ETV1、CASP3、NOTCH3、WNT5A、GLIS1、TNFRSF10B、COL4A6、MMP19、MSR1、PALLD、CCNG2和TMPRSS2表达水平的检测试剂在制备用于癌症预后的产品中的用途;所述癌症为前列腺癌。
6.如权利要求5所述的检测试剂在制备用于癌症预后的产品中的用途,其特征在于,所述癌症预后的确定包括以下步骤:
(a)检测样本的MCM2、GATM、PTGDS、ETV1、CASP3、NOTCH3、WNT5A、GLIS1、TNFRSF10B、COL4A6、MMP19、MSR1、PALLD、CCNG2和TMPRSS2的mRNA表达水平;
(b)根据步骤(a)获得的表达水平数据评估患者的癌症复发风险;
其中步骤(b)中通过以下方法评估患者的癌症复发风险:
风险值=(0.4237×MCM2表达水平)+(0.1915×GATM表达水平)+(-0.1810×PTGDS表达水平)+(0.2629×ETV1表达水平)+(0.0140×CASP3表达水平)+(0.0802×NOTCH3表达水平)+(0.1480×WNT5A表达水平)+(-0.0775×GLIS1表达水平)+(-0.4323×TNFRSF10B表达水平)+(-0.0318×COL4A6表达水平)+(-0.4802×MMP19表达水平)+(0.0775×MSR1表达水平)+(0.0650×PALLD表达水平)+(0.0254×CCNG2表达水平)+(0.0106×TMPRSS2表达水平)。
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