[发明专利]一种皮张中古DNA的提取方法及试剂盒有效
申请号: | 201810465329.3 | 申请日: | 2018-05-16 |
公开(公告)号: | CN108410861B | 公开(公告)日: | 2022-02-22 |
发明(设计)人: | 付巧妹;曹鹏;戴情燕 | 申请(专利权)人: | 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京路胜元知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11669 | 代理人: | 罗巍;路兆强 |
地址: | 100044 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 皮张 中古 dna 提取 方法 试剂盒 | ||
1.一种皮张中古DNA的提取方法,包括样品预处理步骤、消化蛋白步骤、吸附步骤及洗脱步骤;其特征在于:包括如下步骤:
S1样品预处理步骤:通过该样品预处理步骤获得清洁、无外源有机质污染的皮张样品;
步骤S1所述的样品预处理步骤包含:
S1-1:采用紫外处理过的无DNA、RNA污染的刀片或剪刀剔除掉皮张表层的毛发,并取20~30mg皮张,剪碎为1mm3皮张颗粒;
S1-2:将所述皮张颗粒置于低蛋白吸附离心管中,加1mL~2mL的70~80%乙醇,高速震荡洗涤,以>12000rpm离心0.5min~2min;执行此步骤至少2次;
S1-3:将步骤S1-2离心管敞口静置于37~40℃培养箱中,充分去除残留的乙醇;
S2消化蛋白步骤:将protein K/EDTA消化液加入盛装有皮张样品的离心管中,封口密封,于35~38℃下振荡、温育过夜,以消化本步骤反应体系中的大分子蛋白;高速离心处理去除未溶解的皮张样品,留取上清液;
所述消化蛋白步骤采用protein K/EDTA消化液,所述protein K/EDTA消化液为包含蛋白酶K、EDTA、Tween 20的水溶液;所述protein K/EDTA消化液中,蛋白酶K的浓度为0.20mg/mL~40mg/mL,EDTA浓度为0.40mol/L~0.60mol/L,Tween 20的体积分数为0.03~0.08%;
S3吸附:取一定量的所述上清液至盛装有Binding buffer和乙酸钠溶液的离心管中并混匀得混合液,接着将该混合液转移至容纳有带滤膜的吸附柱的离心管中,低速离心处理,使上清液中DNA与滤膜结合,少量小分子蛋白被该滤膜吸附;
所述吸附步骤采用的吸附体系包含Binding buffer、乙酸钠溶液、以及浸泡于所述Binding buffer和乙酸钠的混合液中的带滤膜的吸附柱;所述Binding buffer为包含盐酸胍、无水乙醇、Tween 20的水溶液;所述滤膜为硅基质滤膜;S4纯化:将所述带滤膜的吸附柱转移至新的离心管中,中速离心处理并弃去离心产出的清液,去除去滤膜上吸附的小分子蛋白;
S5清洗纯化:加PE缓冲液至所述吸附柱的滤膜,中速离心处理并弃去离心产出的清液,再次去除滤膜上吸附的小分子蛋白;执行本步骤至少1次;
S6洗脱:将盛装所述带滤膜的吸附柱的离心管进行高速离心干燥,再转移所述带滤膜的吸附柱至另一新的离心管内,加TET洗脱液至所述滤膜上,静置、高速离心;离心产生的清液重新加载至该滤膜上,再次静置和高速离心,将滤膜上的DNA洗脱,得到含DNA的溶液;所述洗脱步骤采用TET洗脱液,所述TET洗脱液是包含三羟甲基氨基甲烷-HCl、EDTA、Tween 20的水溶液;
所述低速离心是指离心转速为1000~2000rpm;中速离心是指离心转速为5000~7000rpm;高速离心是指离心转速为12000~14000rpm。
2.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,所述Binding buffer中,盐酸胍的浓度为3~7mol/L,无水乙醇的体积分数为30~50%,100%Tween 20的体积分数为0.03~0.08%。
3.根据权利要求2所述的提取方法,其特征在于,所述乙酸钠溶液为2~4mol/L,其使用量为Binding buffer体积的2~5%。
4.根据权利要求2所述的提取方法,其特征在于,所述TET洗脱液中,三羟甲基氨基甲烷-HCl的浓度为0.005~0.015mol/L,EDTA浓度为0.0008~0.0012mol/L,Tween 20的体积分数为0.03~0.08%。
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