[发明专利]堪萨斯分枝杆菌的LAMP检测引物组、检测试剂盒及其检测方法在审
申请号: | 201810473250.5 | 申请日: | 2018-05-16 |
公开(公告)号: | CN109280711A | 公开(公告)日: | 2019-01-29 |
发明(设计)人: | 刘厚明;尹小毛;单万水 | 申请(专利权)人: | 深圳市第三人民医院(深圳市肝病研究所) |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/32 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 王会龙 |
地址: | 518000 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 堪萨斯分枝杆菌 检测试剂 引物组 检测 外引物 显色剂 实时荧光定量PCR仪 内引物BIP 内引物FIP 待测样品 待检样品 等温扩增 环引物LB 环引物LF 快速检测 临床标本 颜色变化 荧光染料 样品DNA 观察管 灵敏性 试剂盒 阴阳性 引物液 种检测 荧光 可用 扩增 | ||
1.一种堪萨斯分枝杆菌的LAMP检测引物组,其特征在于,针对堪萨斯分枝杆菌特有的ECHT基因编码序列设计并优化,所述检测引物组包括外引物F3、外引物B3、内引物FIP、内引物BIP、环引物LF和环引物LB,其核酸序列分别如下所示:
外引物F3:5’-GACTGTTGGCGAGTTGGT-3’
外引物B3:5’-GTCCTGGAACGTCTGCTC-3’
内引物FIP:5’-GGTGTGGCACATTGCGACAGATATAACTCGAACAGCAC-3’
内引物BIP:5’-CGGATCAGCGGTATGACGGCCGGCTGCCCGATTAGAT-3’
环引物LF:5’-GTTCTGCGACGGCGATTC-3’
环引物LB:5’-GGGATGCGTTGTCCACCA-3’。
2.根据权利要求1所述的LAMP检测引物组,其特征在于,其特征在于,外引物F3、外引物B3、内引物FIP、内引物BIP、环引物LF和环引物LB在反应体系中的摩尔比为1:1:4:4:2:2。
3.一种堪萨斯分枝杆菌的LAMP检测试剂盒,其特征在于,该检测试剂盒中含有如权利要求1或2所述的堪萨斯分枝杆菌的LAMP检测引物组。
4.根据权利要求3堪萨斯分枝杆菌的LAMP检测试剂盒,其特征在于,其特征在于,还包括以下成分的部分或者全部:(1)DNA聚合酶;(2)LAMP反应液;(2)荧光染料或显色剂;(3)阳性对照和阴性对照。
5.根据权利要求4所述的基于智能恒温扩增技术检测金黄色葡萄球菌的试剂盒,其特征在于:所述DNA聚合酶为Bst DNA聚合酶;LAMP反应液包括dNTP、反应缓冲液、MgSO4和甜菜碱。
6.根据权利要求4所述的基于智能恒温扩增技术检测金黄色葡萄球菌的试剂盒,其特征在于:阳性对照为含有堪萨斯分枝杆菌ECHT基因片段的载体克隆,阴性对照为不含堪萨斯分枝杆菌ECHT基因片段的水或其他溶剂。
7.根据权利要求3堪萨斯分枝杆菌的LAMP检测试剂盒,其特征在于,所述荧光染料为SYBR green,所述显色剂为羟基萘酚蓝。
8.根据权利要求3堪萨斯分枝杆菌的LAMP检测试剂盒,其特征在于,包括以下成分:
(1)引物组:包含权利要求1所述的LAMP检测引物组,外引物、内引物和环引物的浓度均为10μM;
(2)反应液:包括dNTP、反应缓冲液、MgSO4和甜菜碱,使用时需等倍稀释;
(3)Bst DNA聚合酶:浓度为0.16U/μL;
(4)荧光染料或显色剂:荧光染料为SYBR green,显色剂为羟基萘酚蓝(HNB);
(5)密封液:为封闭用石蜡油;
(6)去核酸水:用于补充反应体积。
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