[发明专利]与猪胴体肉品质相关的circRNA标志物及其应用有效
申请号: | 201810496311.X | 申请日: | 2018-05-22 |
公开(公告)号: | CN108676894B | 公开(公告)日: | 2020-11-13 |
发明(设计)人: | 孙加节;张永亮;江青艳;习欠云;陈婷;罗君谊;谢月琴;王伶 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 崔红丽 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 胴体 品质 相关 circrna 标志 及其 应用 | ||
1.一种与猪胴体肉品质相关的circRNA标志物,其特征在于:
所述的circRNA标志物为circLIMCH1,其序列如SEQ ID NO:1所示。
2.一种如权利要求1所述的circRNA标志物的检测引物,其特征在于所述检测引物为:
circLIMCH1的上游引物序列为:5′-GTCTCGCCAGAACCACAGCATTT-3′;
circLIMCH1的下游引物序列为:5′-AGCCAGGTCATCTTGCCATTTGT-3′。
3.权利要求1所述的circRNA标志物或权利要求2所述的检测引物在遗传标记辅助育种及改善猪胴体肉品质中的应用。
4.权利要求1所述的circRNA标志物或权利要求2所述的检测引物在制备遗传标记辅助育种及改善猪胴体肉品质的试剂盒中的应用。
5.一种检测权利要求1所述的circRNA标志物的试剂盒,其特征在于含有权利要求2所述的circRNA标志物的检测引物。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于:
所述的试剂盒还含有针对权利要求1所述circLIMCH1的反转录试剂、内参引物、荧光定量PCR反应液。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于:
所述的内参引物包括GAPDH内参基因的上游引物和下游引物,上游引物序列为SEQ IDNO:5,下游引物序列为 SEQ ID NO:6。
8.权利要求5~7任一项所述的试剂盒在猪肌肉组织中circLIMCH1的定量检测中的应用。
9.一种检测权利要求1所述的circRNA标志物的方法,其特征在于包括如下步骤:
1)提取猪肌肉组织总RNA;
2)通过反转录随机引物在反转录酶的作用下进行circLIMCH1反转录成cDNA;
3)在荧光实时定量PCR仪上将步骤2)获得的cDNA进行扩增检测;
4)通过溶解曲线分析,2-ΔΔCt法进行相对定量。
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