[发明专利]与猪胴体肉品质相关的circRNA标志物及其应用

说明书

本发明公开一种与猪胴体肉品质相关的circRNA标志物及其应用，属于家畜分子标记制备技术领域。所述的circRNA标志物为circLIMCH1，其序列如SEQ ID NO：1所示。该circLIMCH1通过吸附其靶标ssc‑miR‑133a‑5p调控猪肌纤维发育影响猪肉品质，应用于猪肉品质改良方面的辅助遗传选育过程。本发明公开的circLIMCH1可以作为与猪肉品质相关的分子标记，在遗传辅助育种中具有重要的实际应用价值。

技术领域

本发明属于家畜分子标记制备技术领域，具体涉及一种与猪胴体肉品质相关的circRNA标志物及其应用。

背景技术

动物肌肉形成与品质性状改良是家畜育种工作中的最主要研究方向。目前，国内商品猪主要是从国外引进的瘦肉型猪种及其杂交后代，引进品种具有生长速度快，胴体瘦肉率及饲料转化率高等优点；但与我国地方猪种相比，猪抗应激能力与肉品质却显著降低了。近年来，随着消费者对肉品质要求的日益提高，亟需改善肉质，培育优质肉猪。肌纤维是肌肉的基本组成单位。近年来研究表明，肌纤维的组织学特性与肌肉品质特别是食用品质性状(嫩度、风味、多汁性)密切相关，肌纤维的特征在某种程度上决定了肌肉特性。一般而言，氧化型肌纤维直径小，脂质和肌红蛋白含量高，有助于增加肌肉的嫩度、多汁性和风味。比较我国地方猪种(梅山猪、二花脸猪)和引进瘦肉型猪种(大约克、杜洛克、长白猪)发现，加强对瘦肉生长的选择可导致酵解型肌纤维增加，氧化型肌纤维减少，当酵解型肌纤维比例高时，猪肉品质下降。因此，在猪酮体肌肉纤维水平上，分析不同遗传背景猪种与优良性状发生之间的关系，发现优良性状相关基因控制肌纤维发育的机理，对补充和完善当今猪“品种分子设计”技术体系，最终促进我国猪育种技术由传统的“经验育种”向高效的“精确育种”转变已十分必要和重要。

随着“基因组时代”的来临，在全基因组水平上解析性状相关基因表达模式的整体特征，是目前猪育种工作的重要研究方向之一。环状(circRNA)作为一类非编码RNA，在细胞中起到miRNA海绵的效果，进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用。近年来，研究已表明circRNAs在细胞分化与凋亡、生长发育、糖脂代谢、炎症、免疫应答以及肿瘤发生等多个生理和病理过程中均扮演着关键的角色，其中在肌肉生成过程中一些影响肌细胞分化和增殖的circRNA已经被筛选和确定。

发明内容

为了克服现有技术的缺点与不足，本发明的目的在于提供一种与猪胴体肉品质相关的circRNA标志物。

本发明的另一目的在于提供上述circRNA标志物的应用。

本发明通过对长白猪和广东特色品种蓝塘猪肌肉组织进行高通量circRNA测序，筛选与猪肉品质相关的分子标记，经过生物信息学差异表达分析初步选定在瘦肉型长白猪肌肉组织中极显著高表达circLIMCH1，其能通过吸附ssc-miR-133a-5p调控猪肌肉纤维发育影响猪肉品质。本发明还公开了用于检测所述分子标记的检测方法，具有重要的实际应用价值。

本发明的目的通过下述技术方案实现：

本发明提供一种与猪胴体肉品质相关的circRNA标志物，该circRNA标志物为circLIMCH1，其序列如SEQ ID NO：1所示。所述circLIMCH1通过吸附ssc-miR-133a-5p调控猪肉品质，应用于猪肉品质改良方面的辅助遗传选育过程。

进一步，所述circLIMCH1在瘦肉型猪肌肉组织中高表达，在脂肪型猪肌肉组织中低表达并能通过吸附作用负调控ssc-miR-133a-5p发挥作用。

本发明还提供一种circLIMCH1的靶标miRNA，所述靶标miRNA为ssc-miR-133a-5p：5′-AGCUGGUAAAAUGGAACCAAAU-3′，如SEQ ID NO：2所示。

本发明还提供一种上述circRNA标志物的引物，该引物为：