[发明专利]快速检测骨关节感染常见细菌的PCR检测试剂盒及方法在审
申请号: | 201810514985.8 | 申请日: | 2018-05-25 |
公开(公告)号: | CN108411016A | 公开(公告)日: | 2018-08-17 |
发明(设计)人: | 干驰;胡金凤;莫茜;曹清;王志刚;李玉蝉;蔡海清;徐蕴岚;陶悦;赵瑞珂;杜白露;沈楠 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/14;C12Q1/04 |
代理公司: | 上海韧辰专利代理有限公司 31331 | 代理人: | 刘秋兰 |
地址: | 200127 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 骨关节感染 引物组 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 细菌 基因引物 快速检测 试剂盒 引物 金黄色葡萄球菌 铜绿假单胞菌 化脓链球菌 细菌感染 骨关节 检测 耗时 | ||
1.一种快速检测骨关节感染常见细菌的PCR检测试剂盒,其特征在于所述试剂盒包括:
引物组,所述引物组包括:金黄色葡萄球菌或耐甲氧西林金黄色葡萄球菌nuc基因引物、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌mecA基因引物、化脓链球菌spyM基因引物和铜绿假单胞菌oprI基因引物。
2.如权利要求1所述的快速检测骨关节感染常见细菌的PCR检测试剂盒,其特征在于,所述nuc基因引物包括如SEQ ID NO:1所示的上游引物序列和如SEQ ID NO:2所示的下游引物序列;
所述mecA基因引物包括如SEQ ID NO:3所示的上游引物序列和如SEQ ID NO:4所示的下游引物序列;
所述spyM基因引物包括如SEQ ID NO:5所示的上游引物序列和如SEQ ID NO:6所示的下游引物序列;
所述oprI基因引物包括如SEQ ID NO:7所示的上游引物序列和如SEQ ID NO:8所示的下游引物序列。
3.如权利要求1或2所述的快速检测骨关节感染常见细菌的PCR检测试剂盒,其特征在于,所述nuc基因引物、mecA基因引物、spyM基因引物和oprI基因引物的上游引物和下游引物的原始浓度分别为9~11μmol/L优选10μmol/L。
4.如权利要求3所述的快速检测骨关节感染常见细菌的PCR检测试剂盒,其特征在于,在所述引物组中,所述nuc基因引物的上游引物和下游引物的体积各为0.3μL,所述spyM基因引物的上游引物和下游引物的体积各为0.15μL,所述mecA基因引物的上游引物和下游引物的体积各为0.4μL,所述oprI基因引物的上游引物和下游引物的体积各为0.3μL。
5.如权利要求1或2所述的快速检测骨关节感染常见细菌的PCR检测试剂盒,其特征在于,所述PCR检测试剂盒还包括多重PCR缓冲液和多重PCR DNA聚合酶混合液,所述多重PCR缓冲液的体积为12.5μL,所述多重PCR DNA聚合酶混合液的体积为0.125μL。
6.如权利要求1或2所述的快速检测骨关节感染常见细菌的PCR检测试剂盒,其特征在于,所述PCR检测试剂盒包括无菌水的阴性对照。
7.如权利要求1或2所述的快速检测骨关节感染常见细菌的PCR检测试剂盒,其特征在于,所述PCR检测试剂盒还包括DNA标记。
8.如权利要求7所述的快速检测骨关节感染常见细菌的PCR检测试剂盒,其特征在于,所述DNA标记是以金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、化脓链球菌、铜绿假单胞菌标准菌株基因组为模板分别采用PCR扩增纯化后的等体积比混合物。
9.一种使用权利要求1或2所述的PCR检测试剂盒快速检测骨关节感染常见细菌的方法,其特征在于包括如下步骤:
步骤S1基于待检测样品上的细菌制备得到PCR模板;
步骤S2在引物组的特异性的结合下根据PCR模板在PCR反应液中进行PCR扩增;
步骤S3对扩增产物进行电泳检测,与DNA标记对比判断是否感染了金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、化脓链球菌和/或铜绿假单胞菌。
10.如权利要求9所述的方法,其特征在于:在步骤S2中,具体PCR反应液包括:12.5μL多重PCR缓冲液,0.125μL多重PCR DNA聚合酶混合液,10μmol/L nuc基因引物的上游引物如SEQ ID NO:1所示和下游引物如SEQ ID NO:2所示体积各0.3μL,10μmol/L spyM基因引物的上游引物如SEQ ID NO:5所示和下游引物如SEQ ID NO:6所示体积各0.15μL,10μmol/LmecA基因引物的上游引物如SEQ ID NO:3所示和下游引物如SEQ ID NO:4所示体积各0.4μL,10μmol/L oprI基因引物的上游引物如SEQ ID NO:7所示和下游引物如SEQ ID NO:8所示体积各0.3μL,8.075μL无菌水和2μL模板;PCR反应条件为94~95℃预变性3~5min;94~95℃下变性15~20s,60~61℃下退火15~20s,72℃下延伸20s,扩增35个循环;72℃延伸5min。
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