[发明专利]一种检测目标DNA或miRNA的方法在审
申请号: | 201810516888.2 | 申请日: | 2018-05-25 |
公开(公告)号: | CN108676849A | 公开(公告)日: | 2018-10-19 |
发明(设计)人: | 樊春海;王丽华;葛志磊;左小磊;林美华 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海应用物理研究所 |
主分类号: | C12Q1/682 | 分类号: | C12Q1/682 |
代理公司: | 上海智信专利代理有限公司 31002 | 代理人: | 邓琪 |
地址: | 201800 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 工作电极 目标DNA 探针 四面体 种检测 杂交 复合体 生物素 双氧水 辣根过氧化物酶 四甲基联苯胺 电化学信号 水溶液反应 高灵敏度 序列杂交 检出 修饰 输出 检测 | ||
1.一种检测DNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1,提供带有识别序列的DNA四面体探针,所述DNA四面体探针组装在工作电极上形成带有DNA四面体探针的工作电极;
S2,将目标DNA与所述带有DNA四面体探针的工作电极进行杂交形成带有引发序列的工作电极,其中,所述目标DNA的相对的两端分别具有互补序列和所述引发序列,所述互补序列与所述识别序列互补;
S3,将DNA信号探针与所述带有引发序列的工作电极杂交形成带有标记物的工作电极,其中,所述DNA信号探针具有发夹结构序列,所述发夹结构序列的末端具有标记物,所述发夹结构序列与所述引发序列杂交以打开发夹结构序列并使其发生杂交链式反应形成双链聚合物;
S4,通过所述带有标记物的工作电极输出电化学信号,以通过所述电化学信号对所述目标DNA的浓度进行表征。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述标记物为生物素,所述步骤S4包括:
S41,将所述带有生物素的工作电极和亲和素修饰的辣根过氧化物酶反应形成带有第一复合体的工作电极,其中,生物素与亲和素结合;
S42,将带有第一复合体的工作电极与带有双氧水的3,3’,5,5’四甲基联苯胺水溶液反应输出电化学信号,其中,辣根过氧化物酶催化3,3’,5,5’四甲基联苯胺被双氧水氧化。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤S1包括取等量的具有SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示核苷酸序列的四条单链DNA,通过自组装形成DNA四面体探针。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述具有SEQ ID NO.1所示核苷酸序列的单链DNA具有识别序列。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述目标DNA具有SEQ ID NO.5所示核苷酸序列。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述DNA信号探针包括第一探针和第二探针,其中,第一探针和第二探针分别具有SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.7所示核苷酸序列。
7.一种检测miRNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:
P1,提供带有识别序列的DNA四面体探针,所述DNA四面体探针组装在工作电极上形成带有DNA四面体探针的工作电极;
P2,将miRNA helper与所述带有DNA四面体探针的工作电极和目标miRNA进行杂交形成带有引发序列的工作电极,其中,所述miRNA helper的相对的两端分别具有互补序列和所述引发序列;所述互补序列与所述识别序列互补;所述miRNA helper的中部具有结合序列,所述结合序列与所述目标miRNA互补;
P3,将RNA信号探针与所述带有引发序列的工作电极杂交形成带有标记物的工作电极,其中,所述RNA信号探针具有发夹结构序列,所述发夹结构序列的末端具有标记物,所述发夹结构序列与所述引发序列杂交以打开发夹结构序列并使其发生杂交链式反应形成双链聚合物;
P4,通过所述带有标记物的工作电极输出电化学信号,以通过所述电化学信号对所述目标miRNA的浓度进行表征。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述标记物为生物素,所述步骤P4包括:
P41,将所述带有生物素的工作电极和亲和素修饰的辣根过氧化物酶反应形成带有第二复合体的工作电极,其中,生物素与亲和素结合;
P42,将带有第二复合体的工作电极与带有双氧水的3,3’,5,5’四甲基联苯胺水溶液反应输出电化学信号,其中,辣根过氧化物酶催化3,3’,5,5’四甲基联苯胺被双氧水氧化。
9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述步骤P1包括取等量的具有SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示核苷酸序列的四条单链DNA,通过自组装形成DNA四面体探针。
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