[发明专利]用于定量检测间充质干细胞中Twist-1基因表达量的引物、标准品及检测方法在审
申请号: | 201810527337.6 | 申请日: | 2018-05-29 |
公开(公告)号: | CN108690877A | 公开(公告)日: | 2018-10-23 |
发明(设计)人: | 刘宇;张蓉;谭遥;黄晓霞 | 申请(专利权)人: | 成都中创清科医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 成都正华专利代理事务所(普通合伙) 51229 | 代理人: | 李林合 |
地址: | 610041 四川省成都市中国(四川)自*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物 间充质干细胞 标准品 基因表达量 待测样品 检测 标准曲线 定量检测 荧光定量PCR反应 扩增产物回收 反转录合成 重复性检测 引物序列 制备质粒 拷贝数 灵敏度 总RNA 绘制 基因 | ||
1.用于定量检测间充质干细胞中Twist-1基因表达量的引物,其特征在于,所述引物包括:
上游引物5′-GTCCGCGTCCCACTAGC-3′;
下游引物5′-TCCATTTTCTCCTTCTCTGGAA-3′。
2.定量检测间充质干细胞中Twist-1基因表达量的质粒标准品,其特征在于,所述质粒标准品通过以下方法制备得到:
提取间充质干细胞的总RNA,然后反转录合成cDNA;
以cDNA作为模板,采用权利要求1所述引物进行PCR扩增,将PCR扩增片段进行回收、纯化,然后克隆到载体中,制得质粒标准品。
3.根据权利要求2所述的定量检测间充质干细胞中Twist-1基因表达量的质粒标准品,其特征在于,所述反转录体系为:总RNA 0.1ng-5μg、浓度为100μM的Oligo(dT)引物1μl、5×Reaction Buffer 4μl、20U/μl的RiboLock RNase inhibitor 1μl、10mM dNTP MIX 2μl、200U/μl的RevertAid M-Mul V RT 1μl,用nuclease-free water补足至20μl;反转录过程为:42℃60min,接着70℃5min。
4.根据权利要求2所述的定量检测间充质干细胞中Twist-1基因表达量的质粒标准品,其特征在于,所述PCR反应体系为:PrimeSTAR Max Premix 25μl、Primer F 3μl、Primer R3μl、cDNA 100-150ng,用nuclease-free water补足至20μl;PCR反应程序为:95℃预变性2min,95℃变性30s,60℃退火15s,72℃延伸10s,共29个循环,最后72℃延伸5min。
5.定量检测间充质干细胞中Twist-1基因表达量的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取间充质干细胞的总RNA,然后反转录合成cDNA;
(2)以cDNA作为模板,采用权利要求1所述引物进行PCR扩增,将PCR扩增产物进行回收、纯化,用于制备质粒标准品,并绘制标准曲线;
(3)以待测样品cDNA作为模板,采用权利要求1所述引物对其进行荧光定量PCR反应,得到待测样品的Ct值;
(4)根据标准曲线计算出待测样品中Twist-1基因的拷贝数。
6.根据权利要求5所述的定量检测间充质干细胞中Twist-1基因表达量的方法,其特征在于,步骤(1)中反转录体系为:总RNA 0.1ng-5μg、浓度为100μM的Oligo(dT)引物1μl、5×Reaction Buffer 4μl、20U/μl的RiboLock RNase inhibitor 1μl、10mM dNTP MIX 2μl、200U/μl的RevertAid M-Mul V RT 1μl,用nuclease-free water补足至20μl;反转录过程为:42℃60min,70℃5min。
7.根据权利要求5所述的定量检测间充质干细胞中Twist-1基因表达量的方法,其特征在于,步骤(2)中PCR反应体系为:PrimeSTAR Max Premix 25μl、Primer F 3μl、Primer R 3μl、cDNA 100-150ng,用nuclease-free water补足至20μl;PCR反应程序为:95℃预变性2min,95℃变性30s,60℃退火15s,72℃延伸10s,共29个循环,最后72℃延伸5min。
8.根据权利要求5所述的定量检测间充质干细胞中Twist-1基因表达量的方法,其特征在于,荧光定量PCR反应体系为:FAST Universal 2X qPCR Master Mix 10μl、Primer F 0.8μl、Primer R 0.8μl、template 1μl、ROX-low 0.4μl,用nuclease-freewater补足至20μl;荧光定量PCR反应程序为:95℃预变性3min,95℃变性3s,60℃退火25s,共39个循环。
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