[发明专利]一种用于检测脑母细胞瘤易感性相关的SNP位点的引物及检测方法

说明书

本发明提供了一种用于检测脑母细胞瘤易感性相关的SNP位点的引物及检测方法，该引物包括位于rs62315594位点的引物、位于rs3761121位点的引物、位于rs62335293位点的引物以及位于rs5019252位点的引物。采用该引物检测脑母细胞瘤易感性相关的SNP位点多态性的方法，包括以下步骤：(1)采集样品并提取DNA；(2)采用上述引物分别进行目的基因的PCR扩增、胶回收；(3)测定胶回收产物的浓度，进行荧光标记PCR反应，并对反应产物进行纯化；(4)将纯化产物上机测序，并对SNP检测结果进行分析。该引物特异性好、灵敏度高、准确性好，检测方法简单，可预测受检者患脑母细胞瘤的风险。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种用于检测脑母细胞瘤易感性相关的SNP位点的引物及检测方法。

背景技术

人脑母细胞瘤是一种起源于星形胶质细胞的侵袭能力极强、血管分化良好的肿瘤，是原发性恶性脑肿瘤中最常见、死亡率最高的肿瘤，占人类原发恶性脑肿瘤的70％。目前的治疗手段包括手术切除及术后辅助放化疗,然而疾病的预后效果仍然不理想，因此，人脑母细胞瘤的早预测、早预防便显得极其重要。

医学研究表明，所有的疾病或多或少都和基因有一些关联，遗传基因的差异是疾病发生发展中内因的物质基础。单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphsm，SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，它是人类可遗传的基因组变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90％以上。SNP在人类基因组中广泛存在，平均每500-1000个碱基对中就有1个，估计其总数可达300万个甚至更多。

通过检测与脑母细胞瘤易感性相关的SNP，就能够帮助脑母细胞瘤易感人群了解其患脑母细胞瘤的风险，提前做好预防工作，避免脑母细胞瘤的发生，脑母细胞瘤越早发现并及时诊治,治愈机会就越大。

通过检测与脑母细胞瘤易感性相关的SNP位点的多态性，不仅可以从分子遗传学水平上了解细胞癌变机制，而且对脑母细胞瘤的预测、预防、遗传咨询等具有重要意义。

发明内容

针对现有技术中存在的上述问题，本发明提供一种用于检测脑母细胞瘤易感性相关的SNP位点的引物及检测方法，其引物特异性好，检测方法准确性高，可用于脑母细胞瘤的风险评估，为脑母细胞瘤的疾病预防提供指导。

为实现上述目的，本发明解决其技术问题所采用的技术方案是：

一种用于检测脑母细胞瘤易感性相关的SNP位点的引物，这些引物包括位于RTEL1基因rs62315594位点的引物、位于ZGPAT基因rs3761121位点的引物、位于ARFRP1基因rs62335293位点的引物以及位于ZBTB46基因rs5019252位点的引物；

其中，rs62315594位点的引物为F：5′-TGTGTATTCTCCAAACTGC-3′(SEQ ID No：1)和R：5′-AGGAAGTAGACACGCTGA-3′(SEQ ID No：2)；

rs3761121位点的引物为F：5′-AGGTGGACGTCTGTAAGA-3′(SEQ ID No：3)和R：5′-ATGTCTCTATTTCCCTAAGC-3′(SEQ ID No：4)；

rs62335293位点的引物为F：5′-CACCCATCACACCTACC-3′(SEQ ID No：5)和R：5′-GTATGTGCTGCTCTAGTGG-3′(SEQ ID No：6)；

rs5019252位点的引物为F：5′-CAACTCACTTCATGTCTGG-3′(SEQ ID No：7)和R：5′-AAGAAGTATGTGTGCAAGGT-3′(SEQ ID No：8)。

采用上述引物检测脑母细胞瘤易感性相关的SNP位点多态性的方法，包括以下步骤：