[发明专利]一种用于检测卵巢癌基因多态性位点的引物及其检测方法在审

专利信息
申请号: 201810530234.5 申请日: 2018-05-29
公开(公告)号: CN108504741A 公开(公告)日: 2018-09-07
发明(设计)人: 陈思翔;张蓉;黄晓霞;孙正周 申请(专利权)人: 成都中创清科医学检验所有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11
代理公司: 成都正华专利代理事务所(普通合伙) 51229 代理人: 李林合
地址: 610041 四川省成都市中国(四川)自*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 卵巢癌 引物 检测 基因多态性位点 扩增产物 全基因组DNA 多态性位点 序列分析仪 引物特异性 检测结果 浓度测定 易感基因 重大意义 预测 回收 预防 分析
【权利要求书】:

1.一种用于检测卵巢癌基因多态性位点的引物,其特征在于,所述引物包括rs2276109位点的引物、rs2252070位点的引物、rs11782652位点的引物以及rs757210位点的引物,各引物的具体序列如下:

rs2276109-上游引物:5′-TGTCCATACTTACTTCACCA-3′;

rs2276109-下游引物:5′-TCTCCTTCTCTTTTAGTTGC-3′;

rs2252070-上游引物:5′-TGGCAAGATACTCTACCTCT-3′;

rs2252070-下游引物:5′-CTTCAGGTAGACACAAGACA-3′;

rs11782652-上游引物:5′-ATGAAAGGCACCACATT-3′;

rs11782652-下游引物:5′-GATCATTCTTACCCATTCC-3′;

rs757210-上游引物:5′-TGTGAACAGACACAATAACG-3′;

rs757210-下游引物:5′-CTGAAGGGAAGTAGAGAAGA-3′。

2.一种检测卵巢癌基因多态性位点的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)提取受检者全基因组DNA;

(2)以步骤(1)中所得DNA为模板,采用权利要求1中所述引物对其进行PCR扩增;

(3)回收扩增产物,并进行浓度测定,计算模板量,再次进行PCR扩增并对扩增产物进行纯化,最后通过序列分析仪对SNP分型进行分析确定。

3.根据权利要求2所述的检测卵巢癌基因多态性位点的方法,其特征在于,步骤(2)中所述PCR扩增的扩增体系为:Primer STAR MAX 12.5μL、Primer F1.5μL、Primer R 1.5μL、DNA 2μL,最后用H2O补足至25μL。

4.根据权利要求2所述的检测卵巢癌基因多态性位点的方法,其特征在于,步骤(2)中所述PCR扩增的反应条件为:95℃预变性5min,95℃变性10s,55℃退火10s,72℃延伸30s,35个循环,最后72℃延伸2min后于4℃保存。

5.根据权利要求2所述的检测卵巢癌基因多态性位点的方法,其特征在于,步骤(3)中所述PCR扩增的扩增体系为:DTCS Master Mix 2.5μL、Primer R 1.0μL、模板DNA 3μL,最后用灭菌超纯水补足至10μL。

6.根据权利要求2所述的检测卵巢癌基因多态性位点的方法,其特征在于,步骤(3)中所述PCR扩增的反应条件为:94℃预变性30s,94℃变性25s,55℃退火25s,60℃延伸3min,30个循环,最后60℃延伸20min。

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