[发明专利]一种用于检测卵巢癌基因多态性位点的引物及其检测方法在审
申请号: | 201810530234.5 | 申请日: | 2018-05-29 |
公开(公告)号: | CN108504741A | 公开(公告)日: | 2018-09-07 |
发明(设计)人: | 陈思翔;张蓉;黄晓霞;孙正周 | 申请(专利权)人: | 成都中创清科医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 成都正华专利代理事务所(普通合伙) 51229 | 代理人: | 李林合 |
地址: | 610041 四川省成都市中国(四川)自*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 卵巢癌 引物 检测 基因多态性位点 扩增产物 全基因组DNA 多态性位点 序列分析仪 引物特异性 检测结果 浓度测定 易感基因 重大意义 预测 回收 预防 分析 | ||
1.一种用于检测卵巢癌基因多态性位点的引物,其特征在于,所述引物包括rs2276109位点的引物、rs2252070位点的引物、rs11782652位点的引物以及rs757210位点的引物,各引物的具体序列如下:
rs2276109-上游引物:5′-TGTCCATACTTACTTCACCA-3′;
rs2276109-下游引物:5′-TCTCCTTCTCTTTTAGTTGC-3′;
rs2252070-上游引物:5′-TGGCAAGATACTCTACCTCT-3′;
rs2252070-下游引物:5′-CTTCAGGTAGACACAAGACA-3′;
rs11782652-上游引物:5′-ATGAAAGGCACCACATT-3′;
rs11782652-下游引物:5′-GATCATTCTTACCCATTCC-3′;
rs757210-上游引物:5′-TGTGAACAGACACAATAACG-3′;
rs757210-下游引物:5′-CTGAAGGGAAGTAGAGAAGA-3′。
2.一种检测卵巢癌基因多态性位点的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取受检者全基因组DNA;
(2)以步骤(1)中所得DNA为模板,采用权利要求1中所述引物对其进行PCR扩增;
(3)回收扩增产物,并进行浓度测定,计算模板量,再次进行PCR扩增并对扩增产物进行纯化,最后通过序列分析仪对SNP分型进行分析确定。
3.根据权利要求2所述的检测卵巢癌基因多态性位点的方法,其特征在于,步骤(2)中所述PCR扩增的扩增体系为:Primer STAR MAX 12.5μL、Primer F1.5μL、Primer R 1.5μL、DNA 2μL,最后用H2O补足至25μL。
4.根据权利要求2所述的检测卵巢癌基因多态性位点的方法,其特征在于,步骤(2)中所述PCR扩增的反应条件为:95℃预变性5min,95℃变性10s,55℃退火10s,72℃延伸30s,35个循环,最后72℃延伸2min后于4℃保存。
5.根据权利要求2所述的检测卵巢癌基因多态性位点的方法,其特征在于,步骤(3)中所述PCR扩增的扩增体系为:DTCS Master Mix 2.5μL、Primer R 1.0μL、模板DNA 3μL,最后用灭菌超纯水补足至10μL。
6.根据权利要求2所述的检测卵巢癌基因多态性位点的方法,其特征在于,步骤(3)中所述PCR扩增的反应条件为:94℃预变性30s,94℃变性25s,55℃退火25s,60℃延伸3min,30个循环,最后60℃延伸20min。
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