[发明专利]一种用于检测卵巢癌基因多态性位点的引物及其检测方法在审
申请号: | 201810530234.5 | 申请日: | 2018-05-29 |
公开(公告)号: | CN108504741A | 公开(公告)日: | 2018-09-07 |
发明(设计)人: | 陈思翔;张蓉;黄晓霞;孙正周 | 申请(专利权)人: | 成都中创清科医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 成都正华专利代理事务所(普通合伙) 51229 | 代理人: | 李林合 |
地址: | 610041 四川省成都市中国(四川)自*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 卵巢癌 引物 检测 基因多态性位点 扩增产物 全基因组DNA 多态性位点 序列分析仪 引物特异性 检测结果 浓度测定 易感基因 重大意义 预测 回收 预防 分析 | ||
本发明公开了一种用于检测卵巢癌基因多态性位点的引物及其检测方法。该引物的具体序列见SEQ ID NO.1~8,其方法包括以下步骤:(1)提取受检者全基因组DNA;(2)以步骤(1)中所得DNA为模板,采用上述引物对其进行PCR扩增;(3)回收扩增产物,并进行浓度测定,计算模板量,再次进行PCR扩增并对扩增产物进行纯化,最后通过序列分析仪对SNP分型进行分析确定。本发明提供了一种用于检测卵巢癌易感基因多态性位点的引物,设计的引物特异性高、准确性好,能通过检测结果预测受检者患卵巢癌的风险几率,对卵巢癌的预测和预防具有重大意义。
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种用于检测卵巢癌基因多态性位点的引物及其检测方法。
背景技术
卵巢癌(ovarian cancer,LCI)是女性生殖器官常见的恶性肿瘤之一,发病率仅次于子宫颈癌和子宫体癌而列居第三位。但卵巢上皮癌死亡率却占各类妇科肿瘤的首位,对妇女生命造成严重威胁。由于卵巢的胚胎发育、组织解剖及内分泌功能较复杂,早期症状不典型,术前鉴别卵巢肿瘤的组织类型及良恶性相当困难。卵巢恶性肿瘤中以上皮癌最多见,其次是恶性生殖细胞肿瘤。卵巢上皮癌受检者手术中发现肿瘤局限于卵巢的仅占30%,大多数已扩散到子宫,双侧附件,大网膜及盆腔各器官,所以在早期诊断上是一大难题。因此,卵巢癌早期的预测预防和早期诊断对卵巢癌的防治有着重大意义。
约20%的卵巢恶性肿瘤病人有家族史。有三种遗传性卵巢癌综合征,主要是上皮性的,可使有些妇女有极高的患病危险。没有卵巢癌家族史的妇女,其一生的患病危险为1/70,若有1名一级亲属患病,危险增加至5%;若有2名一级亲属患病,危险为7%;若有遗传性卵巢癌综合征的一级亲属,则危险高达50%,并随年龄增长而危险增加。疾病的遗传易感基因检测是当前国内外的热点。而在遗传因素的易感基因检测中,采用单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphsm,SNP)作为基因组标志的关联分析方法较为有效和常用。SNP是指基因组水平上由单个核苷酸变异引起的DNA序列多态性,在人群中的发生频率大于千分之一。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。SNP遗传稳定性强,易于检测。位于基因内部的SNP能直接影响到蛋白质的结构或表达水平,进而影响到组织、器官乃至生理功能。在卵巢癌人群和正常对照人群中进行SNP对比分析,可以确定相关基因多态性与疾病患病风险的关系。通过受检者的血液对卵巢癌易感基因中的关键性基因的遗传位点进行检测,能有效地为卵巢癌的预测、预防提供依据和指导。
发明内容
针对现有技术中的上述不足,本发明提供一种用于检测卵巢癌基因多态性位点的引物及其检测方法,通过受检者的血液对卵巢癌易感基因中的关键性基因的遗传位点进行检测,能有效地为卵巢癌的预测、预防提供依据和指导。
为实现上述目的,本发明解决其技术问题所采用的技术方案是:
一种用于检测卵巢癌基因多态性位点的引物,引物包括rs2276109位点的引物、rs2252070位点的引物、rs11782652位点的引物以及rs757210位点的引物,各引物的具体序列如下:
rs2276109-上游引物:5′-TGTCCATACTTACTTCACCA-3′;(SEQ ID NO.1)
rs2276109-下游引物:5′-TCTCCTTCTCTTTTAGTTGC-3′;(SEQ ID NO.2)
rs2252070-上游引物:5′-TGGCAAGATACTCTACCTCT-3′;(SEQ ID NO.3)
rs2252070-下游引物:5′-CTTCAGGTAGACACAAGACA-3′;(SEQ ID NO.4)
rs11782652-上游引物:5′-ATGAAAGGCACCACATT-3′;(SEQ ID NO.5)
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