[发明专利]一种SKA3基因干扰慢病毒载体及其制备方法在审

专利信息
申请号: 201810532427.4 申请日: 2018-05-29
公开(公告)号: CN108728493A 公开(公告)日: 2018-11-02
发明(设计)人: 吴勇延;高伟;张璐;张宇良;洛鸿洁;李文奇;王斌全;张春明;温树信;牛敏;郑希望;崔佳佳;桑江玮;吴中强;石勇;杨东丽;赵沁丽;薄云峰;李会政 申请(专利权)人: 山西医科大学第一医院
主分类号: C12N15/867 分类号: C12N15/867;C12N15/66
代理公司: 太原申立德知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 14115 代理人: 郭海燕
地址: 030001 *** 国省代码: 山西;14
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摘要:
搜索关键词: 质粒 慢病毒载体 骨架载体 基因干扰 琼脂板 制备 凝胶电泳 靶向 琼脂糖凝胶电泳 基因工程技术 模板DNA序列 转录 单克隆菌 电泳条带 菌液培养 菌液制备 扩大培养 连接产物 模板序列 验证序列 阳性质粒 回收 后提取 基因 菌液 酶切 转化 滞后
【权利要求书】:

1.一种SKA3基因干扰慢病毒载体,其特征是:所述的载体为人源U6启动子转录的靶向人SKA3基因的shRNA模板序列。

2.根据权利要求1所述的SKA3基因干扰慢病毒载体,其特征是:所述人源U6启动子的序列如SEQ.ID.NO.4所示。

3.根据权利要求1所述的SKA3基因干扰慢病毒载体,其特征是:所述靶向人SKA3基因的shRNA模板序列包括三条,即shRNA-1、shRNA-2和shRNA-3,其中shRNA-1基因序列如SEQ.ID.NO.1所示;shRNA-2的基因序列如SEQ.ID.NO.2所示;shRNA-3基因序列如SEQ.ID.NO.3所示。

4.权利要求1-3中任一项所述的SKA3基因干扰慢病毒载体的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:

A1:依次用Age I和EcoR I酶切PLKO.1 puro骨架载体质粒,凝胶电泳回收酶切的PLKO.1puro骨架载体质粒,将靶向人SKA3基因的3条不同shRNA模板DNA序列shRNA-1、shRNA-2和shRNA-3分别与凝胶电泳回收的PLKO.1 puro骨架载体质粒连接,获得3个连接产物,取三个含有100μL的DH5α感受态菌液容器,每个容器中加入一种连接产物25μL,混匀,冰浴25分钟;

A2:取步骤A1冰浴后的三种菌液分别置于相应的离心管中,热激90s,之后迅速冰浴3分钟,再向每个离心管中加入LB液体培养基至1mL,在37℃培养箱中复苏60分钟完成转化,获得三种转化的菌液;

A3:取三个含100ug/mL氨苄青霉素的LB琼脂板,在每个LB琼脂板中加入一种转化的菌液100uL,用涂布棒涂布均匀,37℃倒置培养过夜;

A4:从三个过夜培养的LB琼脂板上挑取单克隆菌,扩大培养后提取质粒,质粒进行琼脂糖凝胶电泳鉴定阳性质粒,阳性质粒电泳条带明显滞后于PLKO.1 puro骨架载体质粒;

A5:阳性质粒通过DNA测序验证序列是否正确,序列与预期完全一致的阳性质粒为目的载体质粒,3条不同shRNA模板序列构建的目的载体质粒分别命名为pLKO.1-shSKA3-1,pLKO.1-shSKA3-2和pLKO.1-shSKA3-3。

5.根据权利要求4所述的SKA3基因干扰慢病毒载体的制备方法,其特征在于,步骤A1所述shRNA模板DNA序列需变性退火处理,变性退火处理的方法是使用PCR仪95℃孵育4min,70℃孵育10min,随后缓慢冷却至室温。

6.根据权利要求4所述的SKA3基因干扰慢病毒载体的制备方法,其特征在于,所述目的载体质粒pLKO.1-shSKA3-1,pLKO.1-shSKA3-2和pLKO.1-shSKA3-3转染Hep2细胞,利用Real-time PCR检测SKA3基因的敲降效率。

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