[发明专利]结直肠癌的DNA甲基化标志物以及利用其检测结直肠癌的方法和试剂盒

权利要求书

1.预测结直肠癌发生的DNA甲基化标志物，所述标志物包括如下基因至少一个的甲基化：DZIP3(cg14787155)和FXYD1(cg17682828)。

2.根据权利要求1的DNA甲基化标志物，所述基因DZIP3(cg14787155)的甲基化包括cg14787155_CpG_12。

3.根据权利要求1或2的DNA甲基化标志物，所述基因DZIP3(cg14787155)的甲基化还包括cg14787155CpG_3.4；CpG_5；CpG_6；CpG_7；CpG_8；CpG_9.10；CpG_11；CpG_12；CpG_14.15；CpG_16。

4.根据权利要求1-3任一项的DNA甲基化标志物，所述基因FXYD1(cg17682828)的甲基化包括cg17682828_CpG_11；优选所述基因FXYD1(cg17682828)的甲基化还包括如下中的至少一个：cg17682828_CpG_2.3(FXYD1)和cg17682828_CpG_9.10(FXYD1)；优选地，还包括cg17682828CpG_4.5；CpG_7.8。

5.根据权利要求1-4任一项的DNA甲基化标志物，所述标志物还包括基因RPS24(cg23620279)的甲基化：cg23620279_CpG_6.7.8(RPS24)或cg23620279_CpG_9(RPS24)。

6.根据权利要求1-5任一项的DNA甲基化标志物，所述标志物还包括基因DAGLB(cg25513090)的甲基化：cg25513090_CpG_7；优选cg23620279_CpG_6.7.8；cg14787155_CpG_14.15；cg17682828_CpG_11；cg25513090_CpG_7。

7.根据权利要求1-6任一项的DNA甲基化标志物，所述标志物包括基因TACC2(cg27089675)或AKT2(cg25333225)的甲基化：

(1)cg17682828_CpG_9.10(FXYD1)-cg27089675_CpG_4(TACC2)；或

(2)cg17682828_CpG_7.8(FXYD1)-cg25333225_CpG_1(AKT2)。

(3)cg14787155_CpG_24(DZIP3)-cg25333225_CpG_4(AKT2)。

8.用于检测权利要求1-7任一项的DNA甲基化标志物的引物对，所述引物对扩增SEQ IDNO.1-6的序列，所述引物对优选为SEQ ID NO.11-SEQ ID NO.22。

9.检测权利要求1所述的DNA甲基化标志物的方法，所述方法包括：

1)提取DNA样品，

2)对所述DNA样品进行亚硫酸盐处理，

3)用权利要求8所述的引物对扩增所述亚硫酸盐处理的样品，获得扩增产物，

4)对所述扩增产物进行消化(例如采用SAP酶)，

5)对所述消化后的扩增产物进行转录和酶切，

6)采用质谱方法对所述转录和酶切产物进行检测，获得样品序列中权利要求1-7任一项所述的DNA甲基化标志物的甲基化情况。

10.一种DNA甲基化标志物检测试剂盒，所述试剂盒包括权利要求8所述的引物对；或者所述试剂盒包括涵盖权利要求1-7任一项所述的甲基化位点的探针序列，其中本公开的CpG位点中的C保持不变或者被T替换。