[发明专利]结直肠癌的DNA甲基化标志物以及利用其检测结直肠癌的方法和试剂盒

说明书

本发明公开了结直肠癌的DNA甲基化标志物以及利用其检测结直肠癌的方法和试剂盒，所述标志物是基因FXYD1、DZIP3、RPS24、AKT2、UBTF、DAGLB、LPAR6、TP63、CX3CR1和TACC2序列的甲基化。本发明还公开了检测所述DNA甲基化标志物的探针、方法和试剂盒，以及利用上述DNA甲基化位点的数据预测结直肠癌发生风险的计算机模块。

技术领域

本发明属于生物技术领域。本发明涉及疾病检测；更具体而言，本发明涉及结直肠癌的DNA甲基化标志物以及利用其检测结直肠癌的方法和试剂盒。

背景技术

我国结直肠癌发病率和死亡率分别位居所有肿瘤发病率和死亡率的第5位，对于癌症，早期筛查的意义远超治疗。常规的结直肠癌诊断的金标准是肠镜，但创伤性，心理感受较痛苦，病人普遍比较抗拒；便潜血试验则需要多次采样，会给病人带来很多不便，从而造成受检者筛查意愿降低，依从性差。肿癌标志物的血液学检查，具有无创、采样方便的特点，可以大大提高受检者的依从性。如果能够有方法对结直肠癌的发生或复发风险进行评估，对于结直肠癌的防治而言，无疑更具意义。

对于合适的结直肠癌标志物研究一直是本领域中的重要问题，需要在结直肠癌标志物方面进行持续的研究。

发明内容

本发明人通过Sequenom MassARRAY甲基化DNA定量分析技术研究结直肠癌患者外周血细胞基因FXYD1、DZIP3、RPS24、AKT2、UBTF、DAGLB、LPAR6、 TP63、CX3CR1和TACC2的甲基化水平与结直肠癌发生的关联，探讨其与结直肠癌发生、作为早期筛查标志物的应用前景。

经过努力，本发明人发现了人的体液中FXYD1、DZIP3和RPS24基因中的多个 DNA甲基化位点与结直肠癌发生显著相关，可以用于预测结直肠癌发生、作为早期筛查标志物。

因此，在第一方面，本公开提供了预测结直肠癌发生的DNA甲基化标志物，所述标志物包括如下基因至少一个的甲基化：DZIP3(cg14787155)和FXYD1 (cg17682828)。

在一个实施方案中，所述基因DZIP3(cg14787155)的甲基化包括 cg14787155_CpG_12。

在一个实施方案中，所述基因DZIP3(cg14787155)的甲基化还包括cg14787155CpG_3.4；CpG_5；CpG_6；CpG_7；CpG_8；CpG_9.10；CpG_11；CpG_12；CpG_14.15； CpG_16。

在一个实施方案中，所述基因FXYD1(cg17682828)的甲基化包括 cg17682828_CpG_11。

在更优选的实施方案中，所述基因FXYD1(cg17682828)的甲基化还包括如下中的至少一个：cg17682828_CpG_2.3(FXYD1)和cg17682828_CpG_9.10(FXYD1)。优选地，还包括cg17682828CpG_4.5；CpG_7.8。

在一个实施方案中，所述标志物还包括基因RPS24(cg23620279)的甲基化：cg23620279_CpG_6.7.8(RPS24)或cg23620279_CpG_9(RPS24)。

在一个实施方案中，所述标志物还包括基因DAGLB(cg25513090)的甲基化：cg25513090_CpG_7；优选cg23620279_CpG_6.7.8；cg14787155_CpG_14.15； cg17682828_CpG_11；cg25513090_CpG_7。

在一个实施方案中，所述标志物包括基因TACC2(cg27089675)或AKT2(cg25333225)的甲基化：

(1)cg17682828_CpG_9.10(FXYD1)-cg27089675_CpG_4(TACC2)；或