[发明专利]一种检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变的方法有效

专利信息
申请号: 201810575835.8 申请日: 2018-06-06
公开(公告)号: CN108753988B 公开(公告)日: 2021-06-04
发明(设计)人: 钟立强;张世勇;王明华;陈校辉;边文冀;秦钦;姜虎成 申请(专利权)人: 江苏省淡水水产研究所
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 南京天华专利代理有限责任公司 32218 代理人: 傅婷婷;瞿网兰
地址: 210017 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 斑点 叉尾鮰 hsp4 基因 隐性 白化 突变 方法
【权利要求书】:

1.一种用于检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变的引物,其特征在于上游引物为SEQ ID NO.1,下游引物为SEQ ID NO.2。

2.权利 要求1所述的引物在检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变种的应用。

3.一种检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变的方法,其特征在于包含以下步骤:

(1)提取待鉴定的斑点叉尾鮰基因组DNA;

(2)以提取的基因组DNA为模板,以权利 要求1所述的引物为扩增引物,PCR扩增斑点叉尾鮰HSP4基因片段;

(3)扩增产物进行直接电泳,根据电泳图谱结果,进行判定:白化个体有99 bp的碱基缺失,只有一条150 bp条带;正常个体HSP4基因没有变化,只有一条249 bp条带;隐性致白化突变携带者个体该基因单链缺乏99 bp,导致同时存在150 bp和249 bp一大一小两条带;

或者

(3)扩增产物纯化后,直接测序,根据测序结果,进行判定:白化个体有99 bp的碱基缺失,序列长度为150bp,正常个体序列长度为249 bp,隐性致白化突变携带者个体该基因单链缺乏99 bp,导致峰形图存在重叠峰。

4.根据权利要求3所述的检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变的方法,其特征在于所述的PCR反应体系为50 μL: 50ng/μL的模板DNA 1 μL,PCR缓冲液 5 μL,dNTP混合液4μL ,每种dNTP 0.1mmol/L, 10 μmol/L的上、下游引物各1 μL,2μL 2 IU 的Taq酶;双蒸水36μL;所述的PCR缓冲液由10mmol/L Tris-HCl,pH9.0, 0.5mmol/L KCl,30mmol/L MgCl2,0.01%明胶组成;PCR扩增反应程序为:94 ℃预变性2 min,94 ℃变性45 s,55 ℃退火1min,72 ℃延伸1 min,经35个循环后再72 ℃延伸10 min。

5.权利要求1所述的特异引物在检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变试剂中的应用。

6.一种检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变试剂,其特征在于包含权利要求1所述的引物。

7.根据权利要求5所述的检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变试剂,其特征在于还包括PCR缓冲液和dNTP混合液,所述的PCR缓冲液由10mmol/L Tris-HCl,pH9.0,0.5mmol/L KCl,30mmol/L MgCl2,0.01%明胶组成。

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