[发明专利]一种检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变的方法有效
申请号: | 201810575835.8 | 申请日: | 2018-06-06 |
公开(公告)号: | CN108753988B | 公开(公告)日: | 2021-06-04 |
发明(设计)人: | 钟立强;张世勇;王明华;陈校辉;边文冀;秦钦;姜虎成 | 申请(专利权)人: | 江苏省淡水水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 傅婷婷;瞿网兰 |
地址: | 210017 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 斑点 叉尾鮰 hsp4 基因 隐性 白化 突变 方法 | ||
1.一种用于检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变的引物,其特征在于上游引物为SEQ ID NO.1,下游引物为SEQ ID NO.2。
2.权利 要求1所述的引物在检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变种的应用。
3.一种检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变的方法,其特征在于包含以下步骤:
(1)提取待鉴定的斑点叉尾鮰基因组DNA;
(2)以提取的基因组DNA为模板,以权利 要求1所述的引物为扩增引物,PCR扩增斑点叉尾鮰HSP4基因片段;
(3)扩增产物进行直接电泳,根据电泳图谱结果,进行判定:白化个体有99 bp的碱基缺失,只有一条150 bp条带;正常个体HSP4基因没有变化,只有一条249 bp条带;隐性致白化突变携带者个体该基因单链缺乏99 bp,导致同时存在150 bp和249 bp一大一小两条带;
或者
(3)扩增产物纯化后,直接测序,根据测序结果,进行判定:白化个体有99 bp的碱基缺失,序列长度为150bp,正常个体序列长度为249 bp,隐性致白化突变携带者个体该基因单链缺乏99 bp,导致峰形图存在重叠峰。
4.根据权利要求3所述的检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变的方法,其特征在于所述的PCR反应体系为50 μL: 50ng/μL的模板DNA 1 μL,PCR缓冲液 5 μL,dNTP混合液4μL ,每种dNTP 0.1mmol/L, 10 μmol/L的上、下游引物各1 μL,2μL 2 IU 的Taq酶;双蒸水36μL;所述的PCR缓冲液由10mmol/L Tris-HCl,pH9.0, 0.5mmol/L KCl,30mmol/L MgCl2,0.01%明胶组成;PCR扩增反应程序为:94 ℃预变性2 min,94 ℃变性45 s,55 ℃退火1min,72 ℃延伸1 min,经35个循环后再72 ℃延伸10 min。
5.权利要求1所述的特异引物在检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变试剂中的应用。
6.一种检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变试剂,其特征在于包含权利要求1所述的引物。
7.根据权利要求5所述的检测斑点叉尾鮰HSP4基因隐性致白化突变试剂,其特征在于还包括PCR缓冲液和dNTP混合液,所述的PCR缓冲液由10mmol/L Tris-HCl,pH9.0,0.5mmol/L KCl,30mmol/L MgCl2,0.01%明胶组成。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于江苏省淡水水产研究所,未经江苏省淡水水产研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201810575835.8/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。