[发明专利]一种一步法同时检测miR-486、miR-146b和miR-15b的方法及其应用在审
申请号: | 201810586721.3 | 申请日: | 2018-06-07 |
公开(公告)号: | CN108982439A | 公开(公告)日: | 2018-12-11 |
发明(设计)人: | 季晨博;郭锡熔;马洁桦;崔县伟;文娟;尤梁惠;曹彦;李沄;王兴;许鹏飞 | 申请(专利权)人: | 南京市妇幼保健院 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64 |
代理公司: | 南京禾易知识产权代理有限公司 32320 | 代理人: | 徐莉芳 |
地址: | 210000 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 茎环 修饰 纳米表面 荧光分子 碱基互补配对 荧光信号分子 茎环结构 探针设计 荧光信号 转录因子 环结构 可检测 灵敏度 一步法 检测 荧光 种茎 猝灭 应用 | ||
1.一种miR-486、miR-146b和miR-15b探针设计方法,其特征在于:所述具体方法步骤如下:
步骤一:设计茎环-miR-486序列为SH-(CH2)6-AAA AAC TCG GGG CAG CTC AGT ACAGGA TTT TT-6-FAM,茎环-miR-146b序列为SH-(CH2)6-AAA AAC AGC CTA TGG AAT TCA GTTCTC ATT TTT-Cy5,茎环-miR-15b序列为SH-(CH2)6-AAA AAT GTA AAC CAT GAT GTG CTGCTA TTT TT-Cy3;
步骤二:步骤一中的三种茎环结构3′端修饰了不同荧光分子,FAM修饰茎环-miR-486,Cy5修饰茎环-miR-146b,Cy3修饰茎环-miR-15b,5′端通过金-巯键修饰到金纳米表面。
2.一种探针修饰AuNPs的方法,其特征在于:所述具体修饰步骤如下:
步骤一:取粒径为50nm的100μL AuNPs,加入TCEP、茎环-miR-486、茎环-miR-146b和茎环-miR-15b;
步骤二:室温下孵育,冷藏备用,TCEP终浓度为1mM,三种茎环的终浓度为0.5μM。
3.一种同时检测miR-486、miR-146b和miR-15b的方法及其应用,其特征在于:所述具体操作步骤如下:
步骤一:AuNPs功能化修饰,加适量TM缓冲液分别溶解合成的三种miRNA探针至100μM的终浓度,再取适量TM缓冲液分别稀释三种miRNA探针至10μM,置于95℃金属浴热击10分钟,然后迅速置于4℃,取粒径为50nm的100μL AuNPs,加入TCEP、茎环-miR-486、茎环-miR-146b和茎环-miR-15b,室温下孵育,冷藏备用,TCEP终浓度为1mM,三种茎环的终浓度为0.5μM;
步骤二:浓度梯度测定,取经步骤一中修饰过的AuNPs,加入浓度范围为1pM-100nM的miR-486、miR-146b和miR-15b,然后室温孵育,进行三种荧光强度检测,荧光测量均由F2500荧光光谱仪实现,各荧光分子的激发和发射波长如下:6-FAM为495nm和521nm,Cy3为550nm和570nm,Cy5为649nm和670nm,6-FAM在495nm处激发,Cy3的激发光为550nm,Cy5为649nm,在521nm处测量6-FAM荧光信号,570nm处检测Cy3荧光信号,670nm处检测Cy5荧光信号,所有激发和发射狭缝宽度均设置为5nm,PMT电压为800V,所有这些检测都记录在室温下,最后得到荧光强度与miRNA浓度的线性关系;
步骤三:利用步骤二所得的标准曲线法对待测样本进行分析检测,分析miR-486、miR-146b和miR-15b的含量;
步骤四:将步骤三中同时检测miR-486、miR-146b和miR-15b的方法应用于肥胖儿童血液中miR-486、miR-146b和miR-15b的检测,预示未来患成人T2D风险。
4.根据权利要求2所述的一种探针修饰AuNPs的方法,其特征在于:所述步骤二中室温孵育时间为1.5h,冷藏备用温度为4℃。
5.根据权利要求3所述的一种同时检测miR-486、miR-146b和miR-15b的方法及其应用,其特征在于:所述步骤一中室温孵育时间为1.5h,冷藏备用温度为4℃,所述步骤二中室温孵育时间为10min。
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