[发明专利]一种丝胶蛋白定量检测方法在审

专利信息
申请号: 201810596604.5 申请日: 2018-06-11
公开(公告)号: CN109030827A 公开(公告)日: 2018-12-18
发明(设计)人: 毛传斌;马璐;杨明英 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: G01N33/68 分类号: G01N33/68;G01N33/531
代理公司: 杭州求是专利事务所有限公司 33200 代理人: 邱启旺
地址: 310058 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 丝胶蛋白 标准曲线方程 定量检测 吸光度 丝胶蛋白溶液 筛选 标准曲线 结合多肽 多肽 构建 扩宽 成功率 绘制 检测 成熟 应用
【权利要求书】:

1.一种丝胶蛋白定量检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)筛选丝胶蛋白亲和多肽。

(2)筛选丝胶蛋白最佳结合多肽。

(3)绘制标准曲线,得到丝胶蛋白浓度和吸光度的标准曲线方程为:y=0.094lgC+0.496,其中,y为吸光度,C为丝胶蛋白浓度。

(4)获得该待检测丝胶蛋白溶液的吸光度,利用步骤3中得到的标准曲线方程就可以得到其对应的浓度。

2.根据权利要求1所述丝胶蛋白定量检测方法,其特征在于,所述步骤1通过以下子步骤来实现:

(1.1)噬菌体消减筛选:将M13噬菌体展示文库用移液器移10μL至24孔板并加入300μL的PBST溶液,然后将其在摇床上以140rpm的速度摇1h;所述PBST溶液由质量含量为99.5%的PBS和质量含量为0.5%的吐温20组成。

(1.2)制备丝胶蛋白薄膜:取300μL浓度为20mg/mL的丝胶蛋白水溶液,滴于24孔板中并室温静置干燥,得丝胶蛋白薄膜,待完全干燥后在丝胶蛋白薄膜上加入300μL的体积含量为90%的乙醇的水溶液,静置十分钟再在孔中加入60μL去离子水,静置30分钟。

(1.3)封闭丝胶蛋白薄膜:除去丝胶蛋白薄膜上的乙醇;并加入400μL的PBST溶液孵育6分钟,除去PBST溶液,从而对丝胶蛋白薄膜上的乙醇进行清洗,重复清洗3次,以充分清洗丝胶蛋白薄膜上的酒精;然后加入400μL封闭液对丝胶蛋白薄膜进行封闭处理,封闭处理需在4℃静置1小时;所述封闭液由质量含量为99.5%的PBS和质量含量为0.5%的BSA组成。

(1.4)丝胶蛋白薄膜和噬菌体的结合:取出步骤1.3封闭好的24孔板,加入400μL的PBST溶液孵育6分钟,除去PBST溶液,从而对丝胶蛋白薄膜上的封闭液进行清洗,重复清洗10次;清洗完成后在丝胶蛋白膜上加入步骤1.1处理后的噬菌体并室温孵育1小时。

(1.5)清洗非特异性结合的噬菌体:取出封闭好的24孔板,加入400μL的PBST溶液孵育6分钟,除去PBST溶液,从而对丝胶蛋白薄膜上不能够进行特异性结合的噬菌体进行清洗,重复清洗10次;接着加入300μL的Glycine-HCl洗脱液,并在室温下静置10min让其充分洗脱,10min后将孔板中的洗脱液全部吸出,装进1.5ml管中并加入45μL的Tris-HCl中和液。对洗脱得到的噬菌体进行浓度测定以确定其浓度。所述Glycine-HCl洗脱液由浓度为0.2M的Glycine水溶液通过HCl调节PH为2.2配置成的。所述Tris-HCl中和液为50mM的Tris水溶液通过HCl调节PH为9.1配置成的。

(1.6)噬菌体的扩增:在装有20ml无菌LB培养液的锥形瓶中加入1ml过夜菌液,将锥形瓶在摇床上摇动20min使细菌菌毛充分伸展。所述过夜菌液由ER2738菌37℃下培养12小时得到。把步骤1.5筛选得到的的噬菌体溶液加到锥形瓶中,然后将锥形瓶静置15min让噬菌体对细菌充分侵染。15min后将已经侵染有噬菌体的细菌培养液在220rpm的摇床上摇4.5h让噬菌体充分进行繁殖,时间到后将锥形瓶取出。

(1.7)噬菌体的第一次纯化:把锥形瓶中的溶液倒进20ml已经进行了灭菌处理的圆底离心管中,配平后把离心管放入离心机中进行离心,离心的速度设置为7000rpm,离心的时间设定为10min。将管中的上清液转移到一个新的圆底离心管中,在其中加入3.3ml的PEG/NaCl溶液,混匀后将溶液放置在4℃的冰箱中让噬菌体过夜沉淀,所述PEG/NaCl溶液是PEG8000和NaCl的水溶液,其中,PEG8000的质量浓度为20%,NaCl的浓度为2.5mol/L。

(1.8)第一次除杂质:24小时后将离心管从冰箱中取出,配平后把离心管在离心机中以12000rpm的速度离心20min。然后弃掉上清液,收集沉淀。用1ml PBS将沉淀再次溶解,接着放入摇床中摇30min。接着取出EP管并配平,以12000rpm的速度在离心机中进行10min的离心,取上清液。

(1.9)噬菌体第二次纯化:把步骤1.8取的上清液用移液器转移到一个1.5ml的EP管中,然后在该EP管中加入0.17ml的PEG/NaCl溶液作为沉淀剂对噬菌体溶液进行再一次的过夜沉淀。

(1.10)第二次除杂质:将过夜沉淀的EP管拿出后配平并在离心机中以12000rpm的速度离心20min。在沉淀剂的作用下,细菌会被离心到EP管的底部,弃掉上清液,加入200μl TBS将沉淀重新溶解并将溶解后的溶液置于140rpm摇床上进行30min的慢摇。随后将EP管放入离心机以12000rpm的转速离心10min,将上清液转移到一个新的EP管中,这个管中的噬菌体溶液即除杂完成的噬菌体溶液。

(1.11)噬菌体的浓度测定:对步骤1.10除杂后的噬菌体进行涂板以测定浓度,并将步骤1.10除杂后的噬菌体加PBS稀释为浓度为1011pfu/ml的溶液并作为新的噬菌体展示文库,按步骤1.1-1.10进行下一轮的筛选,一共进行4轮筛选。

(l.12)对第四轮中步骤1.5洗脱下来的噬菌体进行基因测序,统计不同噬菌体的出现频数,其中,基因序列不同的噬菌体展示不同的多肽。

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