[发明专利]同时检测5种甘蔗病毒的多重RT-PCR方法及其引物和试剂盒有效
申请号: | 201810667802.6 | 申请日: | 2018-06-26 |
公开(公告)号: | CN108728581B | 公开(公告)日: | 2021-02-05 |
发明(设计)人: | 陈保善;邹承武;郭枫;姚姿婷 | 申请(专利权)人: | 广西大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 广西南宁公平知识产权代理有限公司 45104 | 代理人: | 杨立华 |
地址: | 530022 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同时 检测 甘蔗 病毒 多重 rt pcr 方法 及其 引物 试剂盒 | ||
1.同时检测5种甘蔗病毒的多重RT-PCR检测引物组,其特征在于包括六对PCR引物,它们分别针对SCBV、SSV、SCMV、ScYLV、SrMV 5种甘蔗病毒和一个甘蔗内参基因GAPDH,所述六对PCR引物分别具有序列表SEQ.ID.NO.1至SEQ.ID.NO.12的碱基序列,其中奇数序列为正向引物,偶数序列为反向引物;所述多重RT-PCR检测引物组还包括通用接头引物序列Tag-F序列和Tag-R序列,它们分别具有序列表SEQ.ID.NO.13至SEQ.ID.NO.14的碱基序列。
2.含有权利要求1所述引物组的同时检测5种甘蔗病毒的多重RT-PCR检测试剂盒。
3.根据权利要求2所述的同时检测5种甘蔗病毒的多重RT-PCR检测试剂盒,其特征在于包括以下试剂:阳性对照、阴性对照和权利要求1所述引物组。
4.根据权利要求3所述的同时检测5种甘蔗病毒的多重RT-PCR检测试剂盒,其特征在于:所述阳性对照为含有SCBV、SSV、SCMV、ScYLV、SrMV 5种甘蔗病毒的甘蔗总核酸标准品;阴性对照为无病毒甘蔗总核酸;所述引物组为:①预混的针对SCBV、SSV、SCMV、ScYLV、SrMV5种甘蔗病毒和一个甘蔗内参基因GAPDH的反转录引物组(RT Primer Mix,RPM),其为针对上述病毒和内参基因GAPDH的权利要求1中所述反向引物的混合液,以及②预混的针对上述病毒和内参基因GAPDH的PCR引物组(Forward Primer Mix),其为权利要求1所述所有正向引物和接头引物的混合液。
5.利用权利要求1所述引物组的同时检测5种甘蔗病毒的多重RT-PCR检测方法。
6.根据权利要求5所述的同时检测5种甘蔗病毒的多重RT-PCR检测方法,其特征在于所述反转录产物按以下方法制备:采用cDNA第一条链合成试剂盒,以提取的待测甘蔗样品的病毒核酸为模板,在20μL反应体系中加入所有反向引物的混合液RPM,使每条反向引物的终浓度为500nM,反转录制备cDNA模板;反转录体系为20μL,包括病毒核酸2μL,dNTP Mix 4μL,10×RPM 2μL,5×Super RT Buffer 4μL,Super RT 1μL,RNase-Free Water 7μL;反应程序为PCR仪上42℃50min,85℃5min。
7.根据权利要求6所述的同时检测5种甘蔗病毒的多重RT-PCR检测方法,其特征在于PCR的反应体系为:共25μL,包括反转录产物8μL,Forward Primer Mix 2μL,10×Multi HotStart Buffer 2.5μL,Super Pure dNTPs 2μL,MgCl2 2μL,DNA polymerase 0.5μL,ddH2O 6μL;其中Forward Primer Mix中每条正向引物的终浓度为200nM;PCR反应程序为:95℃预变性15min,94℃变性30sec,55℃退火30sec,72℃延伸30sec,35个循环;最后72℃延伸5min。
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