[发明专利]一种用于评价家兔种质遗传多样性的SSR标记组合物及评价方法

权利要求书

1.一种用于评价家兔种质遗传多样性的SSR标记组合物，其特征在于，SSR位点为L8B5、D7Utr5、So162、Sat2、INRACCDDV0007、INRACCDDV0087、INRACCDDV0192、INRACCDDV0185、INRACCDDV0190、INRACCDDV0256、INRACCDDV0346、INRACCDDV0160、INRACCDDV0157、So144、12L4A1、6L1F10、6L3F8、D3Utr2、7L1B 10、19L1C5、So133、So103、12LIE11的组合。

2.根据权利要求1所述的一种用于评价家兔种质遗传多样性的SSR标记组合物，其特征在于，So144位点的引物序列为seqNO.1-2所示，12L4A1位点的引物序列为seqNO.3-4所示，6L1F10位点的引物序列为seqNO.5-6所示，6L3F8位点的引物序列为seqNO.7-8所示，D3Utr2位点的引物序列为seqNO.9-10所示，7L1B10位点的引物序列为seqNO.11-12所示，19L1C5位点的引物序列为seqNO.13-14所示，So133位点的引物序列为seqNO.15-16所示，So103位点的引物序列为seqNO.17-18所示，12LIE11位点的引物序列为seqNO.19-20所示，L8B5位点的引物序列为seqNO.21-22所示，D7Utr5位点的引物序列为seqNO.23-24所示，So162位点的引物序列为seqNO.25-26所示，Sat2位点的引物序列为seqNO.27-28所示，INRACCDDV0007位点的引物序列为seqNO.29-30所示，INRACCDDV0087位点的引物序列为seqNO.31-32所示，INRACCD DV0185位点的引物序列为seqNO.33-34所示，INRACCDDV0190位点的引物序列为seqNO.35-36所示，INRACCD DV0192位点的引物序列为seqNO.37-38所示，INRACCD DV0256位点的引物序列为seqNO.39-40所示，INRACCD DV0346位点的引物序列为seqNO.41-42所示，INRACCD DV0160位点的引物序列为seqNO.43-44所示，INRACCD DV0157位点的引物序列为seqNO.45-46所示。

3.一种家兔种质遗传多样性的评价方法，包括如下步骤：

1)基因组DNA提取及PCR扩增产物检测；

2)毛细管电泳检测SSR荧光标记多样性；

3)不同样本量水平下新西兰白兔群体遗传多样性统计分析；

4)不同标记数水平下新西兰白兔群体遗传多样性统计分析；

5)在最佳样本量水平下，最佳标记数的不同组合遗传多样性分析。

4.根据权利要求3所述的家兔种质遗传多样性的评价方法，其特征在于，步骤1）具体为：提取新西兰白兔全基因组DNA，记录每个家兔样本检测的DNA纯度与浓度，将检测合格的样品，根据测定的浓度加入TE缓冲液使每个样本稀释到100 ng/μL，用于SSR引物的PCR扩增实验。

5.根据权利要求4所述的家兔种质遗传多样性的评价方法，其特征在于，步骤2）具体为：通过Genemapper4.0软件对混合样的电泳结果进行数据处理，处理后生成每个SSR位点不同样本的独立图谱文件；Genemapper4.0能够读取每个家兔样本的测序图谱信息，从而来自动统计并定位出每个峰图对应的各标记位点上的产物浓度、等位基因的片段大小等相关数据；同时可以通过峰型图判断纯、杂合子，双峰表示杂合子，单峰表示纯合子；统计所有个体的位点分布位置；

根据微卫星荧光标记毛细管电泳结果对新西兰白兔群体各遗传多样性参数进行分析，在45个标记130只个体中共检测到184个等位基因数，其中平均等位基因数和平均有效等位基因分别为4.0889、1.9637，平均期望杂合度最小值为0.0078最大值为0.7085，平均值为0.4498；观测杂合度的分布区间在0.0078-0.9380，平均值为0.5111；多态信息含量最小值为0.0077最大值0.6840，平均值为0.3819。