[发明专利]一种用于评价家兔种质遗传多样性的SSR标记组合物及评价方法

说明书

本发明涉及动物育种学、分子遗传学领域，具体涉及一种用于评价家兔种质遗传多样性的SSR标记组合物及评价方法，在利用SSR标记对家兔进行有效遗传评价时，所需样本量和标记数的最适标准，以及最佳组合方式的确定，为家兔优良种质的评估与建立提供一种快速、高效的借鉴与参考方式，并从一定程度上解决测序费用高昂、工作效率低下等难题，弥补家兔领域遗传评价体系的空白。

技术领域

本发明涉及动物育种学、分子遗传学领域，具体涉及一种用于评价家兔种质遗传多样性的SSR标记组合物及评价方法。

背景技术

目前我国现有家兔品种很多，但因缺乏优良家兔种质资源遗传评价的技术标准，出现了优良品种保种效果欠佳等系列问题。微卫星(SSR)标记在不同家兔群体遗传结构中已经有一些应用，但在标记数选用上尚存在着较大的随机性，且样本容量大小缺乏明确的标准。

当前，SSR标记在不同家兔群体的遗传结构中已有一些应用，但样本容量的确定、标记数目的选择尚未制定出明确的标准，存在较大的随机性，使得群体样本容量和标记位点数目在选择上与各种遗传多样性参数之间尚未能建立线性关系。

发明内容

为了克服上述缺陷，本发明提供一种用于评价家兔种质遗传多样性的SSR标记组合物及评价方法，以样本容量和标记数目为参数分别设置不同梯度，分析样本容量和标记数目对群体各遗传多样性参数的影响，建立了家兔种质资源遗传评价体系。

为了实现上述发明目的，本发明所采用的技术方案为：一种用于评价家兔种质遗传多样性的SSR标记组合物，其特征在于，SSR位点为L8B5、D7Utr5、So162、Sat2、INRACCDDV0007、INRACCDDV0087、INRACCDDV0192、INRACCDDV0185、INRACCDDV0190、INRACCDDV0256、INRACCDDV0346、INRACCDDV0160、INRACCDDV0157、So144、12L4A1、6L1F10、6L3F8、D3Utr2、7L1B 10、19L1C5、So133、So103、12LIE11的组合。

So144位点的引物序列为seqNO.1-2所示，12L4A1位点的引物序列为seqNO.3-4所示，6L1F10位点的引物序列为seqNO.5-6所示，6L3F8位点的引物序列为seqNO.7-8所示，D3Utr2位点的引物序列为seqNO.9-10所示，7L1B10位点的引物序列为seqNO.11-12所示，19L1C5位点的引物序列为seqNO.13-14所示，So133位点的引物序列为seqNO.15-16所示，So103位点的引物序列为seqNO.17-18所示，12LIE11位点的引物序列为seqNO.19-20所示，L8B5位点的引物序列为seqNO.21-22所示，D7Utr5位点的引物序列为seqNO.23-24所示，So162位点的引物序列为seqNO.25-26所示，Sat2位点的引物序列为seqNO.27-28所示，INRACCDDV0007位点的引物序列为seqNO.29-30所示，INRACCDDV0087位点的引物序列为seqNO.31-32所示，INRACCD DV0185位点的引物序列为seqNO.33-34所示，INRACCDDV0190位点的引物序列为seqNO.35-36所示，INRACCD DV0192位点的引物序列为seqNO.37-38所示，INRACCD DV0256位点的引物序列为seqNO.39-40所示，INRACCD DV0346位点的引物序列为seqNO.41-42所示，INRACCD DV0160位点的引物序列为seqNO.43-44所示，INRACCD DV0157位点的引物序列为seqNO.45-46所示。

一种家兔种质遗传多样性的评价方法，包括如下步骤：

1)基因组DNA提取及PCR扩增产物检测；

2)毛细管电泳检测SSR荧光标记多样性；

3)不同样本量水平下新西兰白兔群体遗传多样性统计分析；