[发明专利]基于双重PCR对大麦抗黄矮病基因Yd2的分子标记辅助选择方法及专用引物在审
申请号: | 201810695508.6 | 申请日: | 2018-06-29 |
公开(公告)号: | CN108754016A | 公开(公告)日: | 2018-11-06 |
发明(设计)人: | 赵彦宏;王艳芳;李润植;薛金爱;刘林德 | 申请(专利权)人: | 鲁东大学;山西农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京中济纬天专利代理有限公司 11429 | 代理人: | 杨乐 |
地址: | 264025 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 双重PCR 大麦 分子标记辅助选择 检测 专用引物 黄矮病 筛选 抗性 世代 纯合 基因 杂交育种 标记设计 回交育种 紧密连锁 特异引物 育种进程 育种选择 育种周期 基因型 双标记 带型 回交 位点 工作量 判定 育种 | ||
1.一种基于双重PCR对大麦抗黄矮病基因Yd2的分子标记辅助选择专用引物,其特征在于,所述引物为两对特异引物对MYM和MYP,引物对MYM的正向引物序列如SEQ ID No.1所示,其反向引物序列如SEQ ID No.2所示,引物对MYP的正向引物序列如SEQ ID No.3所示,其反向引物序列如SEQ ID No.4所示。
2.一种基于双重PCR对大麦抗黄矮病基因Yd2的分子标记辅助选择方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)提取待检测大麦各育种世代材料的基因组DNA;
(2)以待测大麦材料的基因组DNA为模板,利用与大麦Yd2基因紧密连锁的2个分子标记设计出的2对特异引物对MYM和MYP,进行双重PCR扩增与电泳检测;
(3)根据双重PCR产物电泳检测结果中152bp、100bp、111bp三种条带的出现情况,判定大麦材料是否携带Yd2基因,并直接确定其Yd2基因型;
(4)按照步骤(1)~(3)的方法检测育种分离世代个体后,根据判定的Yd2基因型结果对其各世代分离群体加以选择。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)中所述双重PCR扩增的反应体系为:扩增反应总体积为10μL,含20~50ng大麦模板DNA或者DNA粗提液,1×PCR buffer,0.24mmol L-1dNTP,1.5mmol L-1MgCl2,1.5U Taq DNA聚合酶,MYP标记上下游引物各0.2μmolL-1,MYM标记上下游引物各0.6μmol L-1;
所述双重PCR扩增的反应条件为:94℃预变性5min;94℃变性30s,60℃退火40s,72℃延伸45s,35个循环;最后总延伸5min,4℃保温。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)中所述双重PCR扩增所用引物对的浓度比例为:MYP引物对/MYM引物对=1/3。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)中所述双重PCR产物的电泳检测方法为:采用2.0%~2.3%琼脂糖凝胶进行电泳检测,样品与不含指示剂的上样缓冲液混合后点样;DNA Marker与含指示剂的上样缓冲液混合点样,作为电泳参照物,电泳结束后,凝胶经EB浸泡染色,最后用紫外凝胶成像仪观察电泳结果并拍照。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述大麦材料是否携带Yd2基因,并直接确定其Yd2基因型的具体判断方法为:
①若为152bp+100bp带型,可判定携带Yd2基因,其基因型为Yd2+/Yd2+;
②若为152bp+100bp+111bp带型,则判定携带Yd2基因,其基因型为Yd2+/Yd2-;
③若只出现111bp条带,则不含Yd2基因,其基因型为Yd2-/Yd2-。
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