[发明专利]检测CYP2D6*10基因突变的检测体系及其试剂盒在审

专利信息
申请号: 201810697642.X 申请日: 2018-06-29
公开(公告)号: CN108796051A 公开(公告)日: 2018-11-13
发明(设计)人: 王明;赵国玲;洪专 申请(专利权)人: 上海赛安生物医药科技股份有限公司
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12Q1/6851
代理公司: 上海海颂知识产权代理事务所(普通合伙) 31258 代理人: 任益
地址: 200436 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 核苷酸序列 检测 肽核酸探针 突变 引物探针混合液 上游引物 下游引物 试剂盒 位点 试剂盒灵敏度 突变型基因 样品需求量 定量检测 螯合基团 数字PCR 预混液 种检测 氨基酸
【权利要求书】:

1.一种检测CYP2D6*10基因突变的检测体系,其特征在于:包括数字PCR预混液和引物探针混合液;

所述引物探针混合液包括用于检测CYP2D6基因CYP2D6*10位点的上游引物、下游引物和肽核酸探针;

所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述下游引物的核苷酸序列如SEQID No.2所示,所述肽核酸探针的核苷酸序列与CYP2D6*10突变型基因位点完全互补且核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;

所述肽核酸探针核苷酸序列的5’端连接有由4个氨基酸构成的强螯合基团,4个氨基酸从5’至3’端依次为谷氨酸、丙氨酸、谷氨酸和谷氨酸,或者为天冬氨酸、丙氨酸、谷氨酸和谷氨酸。

2.根据权利要求1所述的检测CYP2D6*10基因突变的检测体系,其特征在于:所述数字PCR预混液中包括DNA聚合酶、超纯水、dNTPs混合液、液滴稳定剂和缓冲液。

3.根据权利要求1所述的检测CYP2D6*10基因突变的检测体系,其特征在于:所述肽核酸探针的5’端设有报告荧光基团FAM,所述肽核酸探针的3’端设有淬灭荧光基团BHQ。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的检测CYP2D6*10基因突变的检测体系,其特征在于:所述上游引物和下游引物在反应体系中的最终浓度均为0.1~0.3μM/L;所述肽核酸探针在反应体系中的最终浓度为0.18~0.25μM/L。

5.一种采用如权利要求1所述的检测体系的检测CYP2D6*10基因突变检测产品。

6.一种检测CYP2D6*10基因突变的试剂盒,其特征在于:包括数字PCR预混液、引物探针混合液、阳性质控和阴性质控;

所述引物探针混合液包括用于检测CYP2D6*10基因位点的上游引物、下游引物和肽核酸探针;

所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述下游引物的核苷酸序列如SEQID No.2所示,所述肽核酸探针的核苷酸序列与CYP2D6*10突变型基因位点完全互补且核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;

所述肽核酸探针核苷酸序列的5’端连接有由4个氨基酸构成的强螯合基团,4个氨基酸从5’至3’端依次为谷氨酸、丙氨酸、谷氨酸和谷氨酸,或者为天冬氨酸、丙氨酸、谷氨酸和谷氨酸;

所述数字PCR预混液包括DNA聚合酶、超纯水、dNTPs混合液、液滴稳定剂和缓冲液;

所述阳性质控是含突变型CYP2D6*10基因标准质粒溶液;

所述阴性质控是含野生型CYP2D6*1基因标准质粒溶液。

7.根据权利要求6所述的检测CYP2D6*10基因突变的试剂盒,其特征在于:所述上游引物和下游引物在反应体系中的最终浓度均为0.1~0.3μM/L;所述肽核酸探针B在反应体系中的最终浓度为0.18~0.25μM/L;所述肽核酸探针的5’端设有报告荧光基团FAM,所述肽核酸探针的3’端设有淬灭荧光基团BHQ。

8.根据权利要求7所述的检测CYP2D6*10基因突变的试剂盒,其特征在于:所述上游引物和下游引物在反应体系中的最终浓度为0.19μM/L;所述肽核酸探针在反应体系中的最终浓度分别为0.21μM/L。

9.根据权利要求6所述的检测CYP2D6*10基因突变的试剂盒,其特征在于:所述数字PCR预混液包括浓度为1U/μL的热启动Taq酶和UDG酶、浓度为4mM的MgCl2、浓度为50mM的pH值为8.3的Tris-HCl、浓度为300mM的dNTP、浓度为1.6μL/反应的液滴稳定剂。

10.根据权利要求6所述的检测CYP2D6*10基因突变的试剂盒,其特征在于:反应时,40体积的反应体系包括数字PCR预混液10体积,引物探针混合液10体积,模板1体积,灭菌超纯水19体积,所述模板的使用浓度为10ng/μL~100ng/μL。

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