[发明专利]一种溺死相关浮游生物复合扩增检测体系及试剂盒有效
申请号: | 201810744431.7 | 申请日: | 2018-07-09 |
公开(公告)号: | CN108950043B | 公开(公告)日: | 2022-02-25 |
发明(设计)人: | 刘超;徐曲毅;杜蔚安;赵建;刘宏;赵鹏;李发院;郭育林;郑卫国;王邦超 | 申请(专利权)人: | 无锡中德美联生物技术有限公司;广州市刑事科学技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/689;C12Q1/04 |
代理公司: | 苏州国诚专利代理有限公司 32293 | 代理人: | 陶纯佳 |
地址: | 214174 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 溺死 相关 浮游生物 复合 扩增 检测 体系 试剂盒 | ||
1.一种溺死相关浮游生物复合扩增检测体系,其特征在于,能够同时快速检测 14 种水藻及2种气单胞菌共 14 个基因,14 种水藻包括普通小球藻、桥弯藻、蛋白核小球藻、舟形藻、异极藻、小环藻、产毒铜绿微囊藻、脆杆藻、念珠藻、针杆藻、血红哈卡甲藻、伊姆裸甲藻、锥状斯克里普甲藻和链状亚历山大甲藻,2种气单胞菌包括杀鲑气单胞菌和维氏气单胞菌,包括用于扩增检测14种藻类的11 个基因位点的引物:硅藻叶绿体rbcl-1(ND-1)、塔玛亚历山大藻COⅠ(JIA COX)、蓝藻核糖体16S(359)、硅藻叶绿体rbcl-2(ND-2)、鱼腥藻属mcyD(mcyD)、菱形藻属核糖体18S(Dia)、筒孢藻属念珠藻科CENA33(CBR)、片状微囊藻16S (WN)、硅藻核糖体23S(UPA-99)、中肋骨条藻线粒体细胞COXⅠ(Cox120)、塔玛亚历山大藻叶绿体psbA(Psba);以及扩增检测2种气单胞菌的3个基因位点的引物:嗜水气单胞菌AER(JUNAER)、维氏气单胞菌聚合酶σ-70因子基因proD(proD-WS)、维氏气单胞菌Hly(HLYA),其中括号内的内容表示引物对应的基因座;
所述 14 对引物核苷酸序列为:硅藻叶绿体rbcl-1基因的引物如SEQ ID NO.1~2所示,塔玛亚历山大藻COⅠ基因的引物如SEQ ID NO.3~4所示,嗜水气单胞菌AER基因的引物如SEQID NO.5~6所示,蓝藻核糖体16S基因的引物如SEQ ID NO.7~8所示,硅藻叶绿体rbcl-2基因的引物如SEQ ID NO.9~10所示,鱼腥藻属mcyD基因的引物如SEQ IDNO.11~12所示,菱形藻属核糖体18S基因的引物如SEQ ID NO.13~14所示,筒孢藻属念珠藻科CENA33基因的引物如SEQ ID NO.15~16所示,片状微囊藻16S基因的引物如SEQ ID NO.17~18所示,硅藻核糖体23S基因的引物如SEQ ID NO.19~20所示,中肋骨条藻线粒体细胞COXⅠ基因的引物如SEQ IDNO.21~22所示,维氏气单胞菌聚合酶σ-70因子基因proD基因的引物如SEQ ID NO.23~24所示,塔玛亚历山大藻叶绿体psbA基因的引物如SEQ ID NO.25~26所示,维氏气单胞菌Hly基因的引物如SEQ ID NO.27~28所示。
2.根据权利要求 1 所述的一种溺死相关浮游生物复合扩增检测体系,其特征在于,所述引物在扩增体系中的终浓度为:SEQ ID NO.1~2:0.2µM;SEQ ID NO.3~4 :0.5µM; SEQ IDNO.5~6:2. 5µM;SEQ ID NO.7~8:0.2µM;SEQ ID NO.9~10:0. 5µM;SEQ ID NO.11~12:1.5µM;SEQ ID NO.13~14:0.2µM;SEQ ID NO.15~16:0.2µM;SEQ ID NO.17~18:0.1µM;SEQ IDNO.19~20:0.1µM;SEQ ID NO.21~22:1.5µM;SEQ ID NO.23~24 :0.6µM;SEQ ID NO.25~26:1.2µM;SEQ ID NO.27~28:1.2µM。
3.根据权利要求 1 所述的一种溺死相关浮游生物复合扩增检测体系,其特征在于,所述 14 个基因位点的引物分组进行荧光染料标记,第一组:硅藻叶绿体rbcl-1、塔玛亚历山大藻COⅠ、嗜水气单胞菌AER、蓝藻核糖体16S、硅藻叶绿体rbcl-2;第二组:鱼腥藻属mcyD、菱形藻属核糖体18S、筒孢藻属念珠藻科CENA33、片状微囊藻16S;第三组:硅藻核糖体23S、中肋骨条藻线粒体细胞COXⅠ;第四组:维氏气单胞菌聚合酶σ-70因子基因proD、塔玛亚历山大藻叶绿体psbA、维氏气单胞菌Hly。
4.根据权利要求 3 所述的一种溺死相关浮游生物复合扩增检测体系,其特征在于,每组引物采用蓝色荧光染料 6-FAM、绿色荧光染料 HEX、黄色荧光染料 TAMRA 、红色荧光染料 ROX 中任一种进行标记,且各组之间的标记色均不相同;内标选用橙色荧光标记,标记物为 SIZ。
5.根据权利要求 3 所述的一种溺死相关浮游生物复合扩增检测体系,其特征在于,所述每对引物中至少有一个引物的5’端进行荧光染料标记。
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