[发明专利]宫颈癌的检测方法在审
申请号: | 201810768528.1 | 申请日: | 2018-07-13 |
公开(公告)号: | CN110714074A | 公开(公告)日: | 2020-01-21 |
发明(设计)人: | 林东旭;魏国鹏 | 申请(专利权)人: | 南京格致基因生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6851 |
代理公司: | 11038 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 | 代理人: | 韩威威;罗菊华 |
地址: | 210000 江苏省南京市江北新区新*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 宫颈癌 检测 热点区域 拷贝数 染色体 扩增 实时定量PCR 试剂盒 | ||
1.用于检测3号染色体上的3q扩增热点区域的相对拷贝数的试剂在制备试剂或试剂盒中的用途,所述试剂或试剂盒用于在确定受试者是否患有宫颈癌或处于发展宫颈癌的风险中的方法中使用,所述方法包括:
a.提供来自所述受试者的样品,
优选地,所述样品是来自所述受试者的基因组样品,
b.检测所述样品中3号染色体上的3q扩增热点区域的拷贝数,
c.检测所述样品中参考染色体区域的拷贝数,和
d.将所述3q扩增热点区域相对于所述参考染色体区域的拷贝数进行归一化,从而获得所述3q扩增热点区域的相对拷贝数,
其中与对照样品中3q扩增热点区域的相对拷贝数相比,所述受试者的样品中3q扩增热点区域的相对拷贝数的升高指示所述受试者患有宫颈癌或处于发展宫颈癌的风险中。
2.权利要求1的用途,其中所述3q扩增热点区域包含3q26.2至3q29的染色体区域,
例如,所述3q扩增热点区域包含3q27至3q29的染色体区域,
例如,所述3q扩增热点区域包含DLG1基因的染色体区域。
3.权利要求1或2的用途,其中所述参考染色体区域包含单拷贝基因的染色体区域,
例如所述参考染色体区域包含ALB基因的染色体区域。
4.权利要求1-3中任一项的用途,其中使用正向引物P1和反向引物P2通过实时定量PCR(qPCR)检测所述样品中3号染色体上的3q扩增热点区域的拷贝数,其中P1和P2与所述3q扩增热点区域上的靶核酸序列杂交。
5.权利要求1-4中任一项的用途,其中使用正向引物P3和反向引物P4通过qPCR检测所述样品中参考染色体区域的拷贝数,其中P3和P4与所述参考染色体区域上的靶核酸序列杂交。
6.用于确定受试者是否患有宫颈癌或处于发展宫颈癌的风险中的试剂或试剂盒,其包含用于检测样品中3号染色体上的3q扩增热点区域的相对拷贝数的试剂。
7.权利要求6的试剂或试剂盒,其中所述用于检测3号染色体上的3q扩增热点区域的相对拷贝数的试剂包括用于通过实时定量PCR(qPCR)检测所述样品中3号染色体上的3q扩增热点区域的拷贝数的试剂,和用于通过实时定量PCR(qPCR)检测所述样品中参考染色体区域的拷贝数的试剂。
8.权利要求6或7的试剂或试剂盒,其中所述3q扩增热点区域包含3q26.2至3q29的染色体区域,
例如,所述3q扩增热点区域包含3q27至3q29的染色体区域,
例如,所述3q扩增热点区域包含DLG1基因的染色体区域。
9.权利要求7或8的试剂或试剂盒,其中所述参考染色体区域包含单拷贝基因的染色体区域,
例如所述参考染色体区域包含ALB基因的染色体区域。
10.权利要求9的试剂或试剂盒,其中所述用于通过实时定量PCR(qPCR)检测所述样品中3号染色体上的3q扩增热点区域的拷贝数的试剂包含与所述3q扩增热点区域上的靶核酸序列杂交的正向引物P1和反向引物P2。
11.权利要求9的试剂或试剂盒,其中所述用于通过实时定量PCR(qPCR)检测所述样品中参考染色体区域的拷贝数的试剂包含与所述参考染色体区域上的靶核酸序列杂交的正向引物P3和反向引物P4。
12.表征来自受试者的样品中3q扩增热点区域的拷贝数扩增的方法,其包括检测所述样品中DLG1基因的相对拷贝数,其中与对照样品中DLG1基因的相对拷贝数相比,所述受试者的样品中DLG1基因的相对拷贝数的升高指示所述3q扩增热点区域的拷贝数发生扩增。
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