[发明专利]用于中间球海胆生长性状的分子标记辅助育种引物及筛选方法

说明书

本发明公开了一种用于中间球海胆生长性状的分子标记辅助育种引物及筛选方法，涉及分子生物学领域。本发明主要采用SLAF‑seq技术和KASP技术对海胆生长性状进行相关的SNP标记，此SNP标记适用于中间球海胆早期辅助选种。本发明通过SLAF‑seq技术使高深度测序保证分型准确、简化的策略降低测序成本、前期简化方案预测保障标记数量最优，通过KASP技术使操作时间和步骤均有所简化，降低了成本。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域，具体涉及一种用于中间球海胆生长性状的分子标记辅助育种引物及筛选方法。

背景技术

目前，对于中间球海胆的育种大多采用杂交育种、选择育种等传统的育种方法，无论是杂交育种还是选择育种，均是以生长性状良好的海胆为标准选择亲本。这些方法均需要在海胆的生长过程中，定期对其生长性状(壳高、壳径、体重)进行测量，并以此作为逐级筛选的标准，这些选择方式不仅耗费大量的人力物力，同时还会因亲本的基因并不是优良基因而导致优良基因型的子代苗种产出量低下。而分子标记辅助育种可提高选种过程的效率，可减少不良基因对选种的影响。

常亚青在早期筛选中间球海胆良种的SNP引物及筛选方法中，采用HRM技术对海胆特定SNP位点基因型的筛选进行分子辅助育种，但该方法仅涉及到一个与生长性状相关的SNP位点检测，对于控制数量性状的优良基因而言检测的位点较少，在应用中有一定局限性。

发明内容

为解决现有技术的问题，本发明基于KASP技术提供一种与中间球海胆生长性状相关的SNP标记及其开发方法，此SNP标记适用于中间球海胆早期辅助选种。

本发明的目的通过以下技术方案来实现：

本发明提供一种用于中间球海胆生长性状的分子标记辅助育种的引物，所述引物选自如下的KASP引物组：

(1)SNP名称Marker49152，标记名称A007402，其对应的引物序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示；

(2)SNP名称Marker112898，标记名称A007399，其对应的引物序列如SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示；

(3)SNP名称Marker140758，标记名称A007397，其对应的引物序列如SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.9所示；

(4)SNP名称Marker63934，标记名称A007389，其对应的引物序列如SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示；

(5)SNP名称Marker203513，标记名称A007388，其对应的引物序列如SEQ IDNO.13、SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.15所示；

(6)SNP名称Marker24433，标记名称A007376，其对应的引物序列如SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18所示；

(7)SNP名称Marker72763，标记名称A007374，其对应的引物序列如SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.21所示；

(8)SNP名称Marker23360，标记名称A007366，其对应的引物序列如SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.24所示；

(9)SNP名称Marker13442，标记名称A007362，其对应的引物序列如SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.26和SEQ ID NO.27所示；