[发明专利]一种一锅法滚环扩增技术检测单核苷酸多态性的方法在审
申请号: | 201810793176.5 | 申请日: | 2018-07-18 |
公开(公告)号: | CN109022554A | 公开(公告)日: | 2018-12-18 |
发明(设计)人: | 朱文远;周琳莹;郝杰;梁晓琳;潘宏程;郭自宽 | 申请(专利权)人: | 桂林理工大学 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 541004 广西壮*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 滚环扩增 一锅法 单核苷酸多态性 技术检测 扩增 缓冲体系 目标序列 溶液混合 锁式探针 原位检测 缓冲液 聚合酶 连接酶 灵敏度 分析 | ||
1.一种一锅法滚环扩增技术检测单核苷酸多态性的方法,其特征在于具体步骤为:
(1)一锅法滚环扩增:将1μL浓度为1μmol/L的锁式探针、1μL浓度为10 mmol/L的四种脱氧核糖核苷三磷酸的混合物即dNTPs和8μL的焦碳酸二乙酯处理的蒸馏水即DEPC水混合组成10 μL A预混液,再将2μL 10×Taq DNA 连接酶 Buffer、2μL10× Bst DNA 聚合酶Buffer、1μL浓度为10 nmol/L的待测靶序列、0.5μL 40U/μL的Taq DNA连接酶、0.5μL 8U/μL的Bst DNA聚合酶以及4μL DEPC水混合组成10 μL B预混液,然后将A预混液和B预混液混合均匀,用移液枪吹打均匀,以上操作均在冰面上进行,然后至于55℃下反应6小时,于80℃下20分钟使酶失活以终止扩增反应;
(2)单核苷酸多态性分型测定:取步骤(1)中的扩增产物5μL、1μL 6×Loading Buffer和0.6μL 100×Syber GreenⅠ工作液,室温放置5分钟,灌胶后点样到质量浓度为1%的琼脂糖凝胶中,跑胶时用1×TBE缓冲液,即0.04 mol/L Tris-硼酸,0.001 mol/L EDTA,pH=8.0,在100V电压下跑胶40分钟,在凝胶成像仪下成像,保存图片;
(3)单核苷酸多态性荧光检测:取步骤(1)中的扩增产物2 μL、2 μL 20×Syber GreenⅠ溶液,用10 mmol/L磷酸盐缓冲溶液pH7.4溶液稀释到100 μL,室温下保持10-15分钟,用350μL的微量比色皿测定,荧光测量时选择激发波长为495 nm,光谱记录范围从505 nm到700nm,在534 nm处测定其荧光信号强度。
2.如权利要求1所述的一锅法滚环扩增技术检测单核苷酸多态性的方法,其特征在于所述步骤(1)混合后的20μL溶液中含有pH7.6 40 mmol/L Tris-HCl,25 mmol/L KAc,10mmol/L Mg(Ac)2,10 mmol/L二硫苏糖醇即DTT,1 mmol/L 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸即NAD,10mmol/L KCl,10 mmol/L (NH4)2SO4,2 mmol/L MgSO4,质量百分比浓度为0.2% Triton X-100,20U Taq DNA连接酶,4U的Bst DNA聚合酶100 nmol/L锁式探针和500μmol/L的dNTP,0.5 nmol/L目标核酸。
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