[发明专利]杨树叶绿体全基因组PCR扩增引物及其应用有效

专利信息
申请号: 201810828466.9 申请日: 2018-07-25
公开(公告)号: CN108841991B 公开(公告)日: 2022-04-22
发明(设计)人: 何承忠;纵丹;周安佩;李旦;段丽华;张壵;邹辛联 申请(专利权)人: 西南林业大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 昆明祥和知识产权代理有限公司 53114 代理人: 张亦凡
地址: 650000 云*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 杨树 叶绿体 基因组 pcr 扩增 引物 及其 应用
【权利要求书】:

1.杨树叶绿体全基因组PCR扩增引物,其特征在于共有33对引物,分别包括上游引物和下游引物,

所述33对引物如下:

2.如权利要求1所述的引物在杨树叶绿体全基因组序列PCR扩增中的应用,其特征在于具体步骤如下:

1)从杨树样本材料嫩叶中提取到总DNA样品;

2)用权利要求1所述的引物进行PCR扩增,由于每对引物扩增产物长度均在4kb及以上,采用长片段PCR扩增技术进行杨树叶绿体全基因组序列的目的片段的扩增;

3)步骤2)得到的PCR扩增产物经0.5%琼脂糖凝胶电泳检测,若存在分子量与特异引物设计扩增长度相一致的单一条带,则说明扩增成功;

4)将步骤3)中经过检测扩增成功的33对特异引物PCR产物送生物技术公司,经过产物纯化、定量与均一化、pacbio文库制备及Sequel/RSII测序,去除测序片段两端的barcode序列,经过reads聚类分析及subreads的自我矫正,采用minimus2进行拼接组装,得到杨树叶绿体全基因组序列;

5)应用OGdraw软件构建杨树叶绿体全基因组结构图。

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