[发明专利]杨树叶绿体全基因组PCR扩增引物及其应用有效
申请号: | 201810828466.9 | 申请日: | 2018-07-25 |
公开(公告)号: | CN108841991B | 公开(公告)日: | 2022-04-22 |
发明(设计)人: | 何承忠;纵丹;周安佩;李旦;段丽华;张壵;邹辛联 | 申请(专利权)人: | 西南林业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 昆明祥和知识产权代理有限公司 53114 | 代理人: | 张亦凡 |
地址: | 650000 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 杨树 叶绿体 基因组 pcr 扩增 引物 及其 应用 | ||
1.杨树叶绿体全基因组PCR扩增引物,其特征在于共有33对引物,分别包括上游引物和下游引物,
所述33对引物如下:
2.如权利要求1所述的引物在杨树叶绿体全基因组序列PCR扩增中的应用,其特征在于具体步骤如下:
1)从杨树样本材料嫩叶中提取到总DNA样品;
2)用权利要求1所述的引物进行PCR扩增,由于每对引物扩增产物长度均在4kb及以上,采用长片段PCR扩增技术进行杨树叶绿体全基因组序列的目的片段的扩增;
3)步骤2)得到的PCR扩增产物经0.5%琼脂糖凝胶电泳检测,若存在分子量与特异引物设计扩增长度相一致的单一条带,则说明扩增成功;
4)将步骤3)中经过检测扩增成功的33对特异引物PCR产物送生物技术公司,经过产物纯化、定量与均一化、pacbio文库制备及Sequel/RSII测序,去除测序片段两端的barcode序列,经过reads聚类分析及subreads的自我矫正,采用minimus2进行拼接组装,得到杨树叶绿体全基因组序列;
5)应用OGdraw软件构建杨树叶绿体全基因组结构图。
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