[发明专利]阴沟肠杆菌blaNDM-1基因敲除的方法及应用在审

专利信息
申请号: 201810834010.3 申请日: 2018-07-26
公开(公告)号: CN108949797A 公开(公告)日: 2018-12-07
发明(设计)人: 杜艳;尧静;李娅;宋宇 申请(专利权)人: 昆明医科大学第一附属医院
主分类号: C12N15/74 分类号: C12N15/74;C12N15/66
代理公司: 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 代理人: 汤东凤
地址: 650032 云*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 阴沟肠杆菌 基因敲除 基因表达量 验证 菌株 敲除 基因工程技术 基因功能 耐药性 生长 测序 可用 体外 整合 应用 成功 基因 保留 研究
【权利要求书】:

1.一种阴沟肠杆菌blaNDM-1基因敲除的方法,其特征在于:包括以下步骤:

步骤一、阴沟肠杆菌质粒抗性改造

采用质粒小提取试剂盒对氨苄青霉素耐药的阴沟肠杆菌质粒提取,通过PCR扩增四环素抗性基因片段,并采用DNA纯化回收试剂盒纯化回收四环素抗性基因片段的PCR产物,将纯化的PCR产物进行酶切连接反应得到酶切连接产物,并将其转化人大肠埃希菌DH5α感受态细胞后进行酶切鉴定重组质粒;

步骤二、Red重组系统依托质粒转化入阴沟肠杆菌

采用超级感受态细胞制备试剂盒制备阴沟肠杆菌感受态细胞,将步骤一得到的重组质粒转化入制备的阴沟肠杆菌感受态细胞,对细菌基因组DNA进行提取得到阳性克隆阴沟肠杆菌;

步骤三、同源重组片段的制备和纯化

先通过PCR扩增同源重组片段,采用DNA纯化回收试剂盒纯化回收PCR产物,并进行DNA浓缩处理;

步骤四、阴沟肠杆菌电击感受态细胞的制备及同源重组片段的电转化

步骤五、PCR鉴定阴沟肠杆菌ΔNDM-1∷Kn重组子

步骤六、卡那霉素抗性基因的去除

制备阴沟肠杆菌ΔNDM-1∷Kn感受态细胞,将pCP20质粒转化入阴沟肠杆菌ΔNDM-1∷Kn感受态细胞,过夜培养,隔天对单克隆菌落进行氯霉素和卡那霉素敏感检测,对其敏感的菌落为blaNDM-1基因敲除的阴沟肠杆菌。

2.如权利要求1所述的一种阴沟肠杆菌blaNDM-1基因敲除的方法,其特征在于:所述步骤一酶切连接反应为:限制性内切酶对待改造质粒和PCR产物进行酶切;采用DNA凝胶回收试剂盒回收酶切DNA片段并采用T4连接酶连接酶切片段得到酶切连接产物。

3.一种如权利要求1阴沟肠杆菌blaNDM-1基因敲除的方法敲除blaNDM-1基因的阴沟肠杆菌的验证方法,包括:采用RNA试剂盒提取RNA;通过反转录系统对RNA进行反转录聚合酶链反应;之后对blaNDM-1基因进行检测。

4.一种阴沟肠杆菌blaNDM-1基因敲除的应用,其特征在于:应用阴沟肠杆菌blaNDM-1基因敲除方法制备的敲除blaNDM-1基因的阴沟肠杆菌在鉴定blaNDM-1基因对菌株的耐药性和体外竞争力和生长能力的影响。

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