[发明专利]二维MS/MS采集模式

说明书

公开了一种二维MS/MS采集模式。具体地，披露了一种质谱方法，包括进行多个实验运行，其中每个实验运行包括：在多个时间间隔对碎片或产物离子周期性地进行质量分析，其中在所述实验运行的开始与所述碎片或产物离子被质量分析的第一时间间隔之间提供延迟时间。在实验运行的不同实验运行中提供不同的延迟时间，并且在至少一个所述实验运行中在相同的时间间隔内分析的以及在至少另一个所述实验运行中在不同的时间间隔内分析的碎片或产物离子被识别作为感兴趣的碎片或产物离子。因此，这些碎片或产物离子被确定为与不同的前体离子相关联并且用于识别它们相应的前体离子。

相关申请的交叉引用

本申请要求2014年6月11日提交的英国专利申请号1410346.9和2014年9月4日提交的欧洲专利申请号14183486.1的优先权和权益。这些申请的全部内容通过引用并入本文。

背景技术

已知在串联质谱仪，例如四极杆-飞行时间质谱仪(“Q-ToF”)，上采用数据依赖性采集(“DDA”)。根据这样的已知技术，在测量扫描中确定母离子或前体离子的质荷比。四极杆质量过滤器然后根据其质荷比顺序分离每个单独的母离子或前体离子，并将其加速进入碰撞室以产生产物离子。然后在飞行时间质量分析器中对产物离子进行质量分析。然而，当母离子或前体离子被分离时，其他母离子或前体离子被丢弃，导致低占空比。此外，根据该技术的母离子或前体离子选择导致一些偏差。例如，如果选择20个最强的前体离子，这将使数据偏向最丰富的物质。

在US 6717130(Micromass)中披露了对该方法的改进，其中不分离并且选择前体离子，而是通过将它们的检测时间与母体物质从色谱柱洗脱的时间相关联而将碎片离子分配于母离子。该技术提高了仪器的占空比，并最小化了偏置采集。然而，该技术遭受特异性限制，因为在碎裂点，母离子仅通过色谱彼此分离。

四极杆-飞行时间质谱仪的已知操作模式是以具有例如25Da的传输窗的低分辨率模式操作四极杆质量过滤器。然后，由四级质量过滤器传输的离子的质荷比范围以约25Da的步长且以不依赖于数据的方式顺序递增。离开四级质量过滤器的离子被加速到气室中并且通过飞行时间质量分析器对所得碎片离子进行质量分析。将来自每个25Da窗口的数据保持分离用于处理。这种技术在采集的性质上是无偏差的并且具有比利用较窄的质荷比分离窗口操作的装置改进的占空比。然而，该技术具有有限的前体离子特异性，因为任何给定的碎片离子可以属于在25Da窗口内传输的任何前体离子。

因此，希望提供改进的质谱方法和改进的质谱仪。

发明内容

从第一方面，本发明提供了一种质谱方法，包括：

a)进行多个实验运行，其中每个实验运行包括：

i)将前体离子质量选择性地传输到碎裂或反应装置中，其中所传输的前体离子的质荷比作为时间的函数变化，

ii)在所述碎裂或反应装置中使所述前体离子碎裂或反应，以便产生碎片或产物离子，

iii)在多个时间间隔对所述碎片或产物离子周期性地进行质量分析，其中在所述实验运行的开始与所述碎片或产物离子被质量分析的第一时间间隔之间提供延迟时间；

b)在所述实验运行的不同实验运行中提供不同的延迟时间；

c)识别在所述实验运行之一中在第一个时间间隔内分析的以及在所述实验运行的至少另一个中在不同时间间隔内分析的碎片或产物离子，作为感兴趣的碎片或产物离子；

d)使用所述第一时间间隔和/或所述不同时间间隔的定时来识别所述感兴趣的碎片或产物离子的相应前体离子。

预期实验之间的时间延迟变化可以用于精确地分析离子。例如，一个种类的离子可以在具有第一延迟时间的第一实验运行中在一个时间间隔中分析，但是可以在具有不同延迟时间的不同实验运行中在不同的时间间隔中分析。然后可以使用不同时间间隔的定时来精确地分析离子种类。