[发明专利]寨卡病毒的qPCR检测方法在审
申请号: | 201810890510.9 | 申请日: | 2018-08-07 |
公开(公告)号: | CN108950077A | 公开(公告)日: | 2018-12-07 |
发明(设计)人: | 陈国强;时长军;李永旺;王凯民;张嵘;姜珊;朱婷;陆春华 | 申请(专利权)人: | 中华人民共和国苏州出入境检验检疫局;苏州西山生物技术有限公司;江苏出入境检验检疫局动植物与食品检测中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人: | 马明渡;杨超 |
地址: | 215021 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 寨卡病毒 待测样品 重组质粒 标准品 检测 熔解曲线分析 上游引物序列 下游引物序列 标准曲线 扩增反应 一对引物 荧光信号 靶序列 灵敏性 核酸 引物 采集 病毒 | ||
1.一种寨卡病毒的引物对,其特征在于:其中一条引物ZIKV-F为针对寨卡病毒的NS5基因设计的上游引物,该上游引物的序列为5’- GCCGCCACCAAGATGAACTGAT-3’;另一条引物ZIKV-R为针对寨卡病毒的NS5基因设计的下游引物,该下游引物的序列为5’-GGTCGTTCTCCTCAATCCACACTC-3’ 。
2.一种寨卡病毒的qPCR检测方法,其特征在于:该检测方法包括以下步骤:
第一步,引物和标准品重组质粒的合成:针对寨卡病毒的NS5基因设计了权利要求1所述的一对引物,所述引物在ZIKV/Monkey/Uganda/MR766/1947株的靶序列被人工连接到pUC57载体上,形成标准品重组质粒;
第二步,分别以所述标准品重组质粒和待测样品中的核酸为模板,进行qPCR扩增反应,其中,所述标准品重组质粒的梯度浓度为2.0×108~2.0×10-1 copies/μL,每个梯度浓度重复3次,qPCR扩增反应的20 μL反应体系为:
2×SYBR® Premix Ex Taq™(TliRNaseH Plus) 10 μL;
50×ROX 0.4 μL;
引物ZIKV-F 20 μM,0.2 μL;
引物ZIKV-R 20 μM,0.2 μL;
去离子水 4.2 μL;
核酸模板 5 μL;
qPCR扩增反应后,采集荧光信号,得到qPCR产物的Ct值并进行熔解曲线分析,当Ct值<36且Tm值在86~87℃之间时,代表生物样品中含有寨卡病毒,为阳性;当Ct值≥36,且Tm值小于86℃或大于87℃时,代表生物样品中不含有寨卡病毒,为阴性;
第三步,通过所述标准品重组质粒的Ct值和各个梯度浓度建立标准曲线,最后,根据标准曲线和待测样品的Ct值得到待测样品的含量。
3.根据权利要求2所述的寨卡病毒的qPCR检测方法,其特征在于:在所述第二步中,qPCR扩增反应条件为:95℃预变性30 s,之后扩增40个循环,每个循环95℃变性5 s,60℃退火延伸31 s,采集信号;循环结束后95℃变性15 s,60℃退火延伸1 min,95℃变性15 s,60℃退火延伸15 s,读值并绘制熔解曲线。
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