[发明专利]基于illumina平台的乳腺癌分型检测试剂盒及应用在审
| 申请号： | 201810895547.0 | 申请日： | 2018-08-08 |
| 公开（公告）号： | CN109097467A | 公开（公告）日： | 2018-12-28 |
| 发明（设计）人： | 张吉保;张明航;岳伟 | 申请（专利权）人： | 江苏苏博生物医学科技南京有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人： | 薛海霞;董建林 |
| 地址： | 210000 江苏省南京*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 引物 分型检测试剂 乳腺癌 链霉素 磁珠 降解 样本 基因表达定量 生物技术领域 表达谱分析 测序试剂 传统应用 磁性珠粒 磁珠包被 定量试剂 末端测序 随机引物 荧光定量 生物素 微阵列 转录组 包被 测序 建库 上机 文库 应用 分析 | ||
1.基于illumina平台的乳腺癌分型检测试剂盒，其特征在于，该分型检测试剂盒包括a)降解mRNA建库试剂、引物及磁珠模块；b)文库定量试剂模块；c)上机测序试剂模块；所述的引物包括seq ID NO.1所示的Bio-B-TVN引物、seq ID NO.2所示的Primer-A随机引物、seq ID NO.3所示的Primer-A引物、seq ID NO.4-6任意一个所示的Primer-B引物，磁珠为包被有链霉素的磁性珠粒，Bio-B-TVN引物上的生物素可与磁珠包被的链霉素相结合，Primer-B引物为带有8碱基index的接头序列。
2.根据权利要求1所述的基于illumina平台的乳腺癌分型检测试剂盒，其特征在于，文库定量试剂模块所用到的定量试剂盒为VAHTS Library Quantification Kit forIllumina。
3.根据权利要求1所述的基于illumina平台的乳腺癌分型检测试剂盒，其特征在于，上机测序试剂模块所使用的测序试剂盒为NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2，所用到的试剂溶液为0.2N的NaOH、200mM PH7的Tris-Cl。
4.根据权利要求3所述的基于illumina平台的乳腺癌分型检测试剂盒，其特征在于，上机测序试剂模块所用的软件包为python package HTSeq、GSNAP aligner和DAVID工具包。
5.根据权利要求1所述的基于illumina平台的乳腺癌分型检测试剂盒，其特征在于，降解mRNA建库试剂、引物及磁珠模块具体组成为：
。
6.如权利要求1-5任意一项所述的乳腺癌分型检测试剂盒作为乳腺癌基因的表达谱差异分析和乳腺癌分型的试剂的应用。
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