[发明专利]一种CsTTG1基因与茶叶茸毛生长发育线性关系的鉴定方法有效

专利信息
申请号: 201810896148.6 申请日: 2018-08-08
公开(公告)号: CN108950047B 公开(公告)日: 2020-11-13
发明(设计)人: 孙彬妹;代风玲;刘任坚;刘少群;肖熙 申请(专利权)人: 华南农业大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895
代理公司: 广州市时代知识产权代理事务所(普通合伙) 44438 代理人: 卢浩
地址: 510642 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 csttg1 基因 茶叶 茸毛 生长发育 线性 关系 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.一种CsTTG1基因与茶叶茸毛生长发育线性关系的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:S1.选取待测茶树品系,取茶树品系茶叶的顶芽、第二叶、第三叶、老叶;

S2.分别提取茶叶的顶芽、第二叶、第三叶、老叶的RNA序列;

S3.将提取的RNA序列分别反转录成cDNA;

S4. 以cDNA为模板,通过特异性引物对进行PCR扩增; S5.对PCR扩增的产物进行测序,检测分析CsTTG1在茶叶茸毛生长发育线性关系中是否具有特异性表达:将PCR扩增产物用融解曲线分析,采用Roche公司的LightCylcer480软件收集数据,在茶树不同的样品间相对表达量的计算,用CT值的2-△CT法处理获得其茶叶茸毛生长发育线性关系;

步骤S4中,所述PCR扩增的方法包括将反转录产物为模板、通过PCR扩增引物进行qRT-PCR反应,所述PCR扩增引物其上游引物和下游引物的序列分别如SEQ ID NO:1和SEQ IDNO:2所示。

2.根据权利要求1所述的CsTTG1基因与茶叶茸毛生长发育线性关系的鉴定方法,其特征在于,步骤S2中,所述茶叶的RNA序列提取方法包含以下步骤:

(1)往预冷的2.0ml的离心管中加入700uml的Buffer PRC1液;

(2)称取50-100mg样品材料置于加有液氮的研钵中,迅速磨成粉末状并转到第1步的离心管中,高速涡旋60秒打散样品,冰上放置5min ,55℃短暂水浴1分钟;

(3)冷却到室温,14000rpm离心5min;

(4)把gDNA过滤柱装在2ml收集管中,把第3步的上清液转移在gDNA过滤柱中,14000rpm离心2min,弃掉gDNA过滤柱;

(5)加入0.5倍体积的无水乙醇至滤纸中,移液枪吸打3-5次,按第6步进行操作;

(6)把HiPure RNA Mini Column 装在2ml收集中,转移700ul 混合液至柱子中,10000rpm离心60s;

(7)倒弃滤液,把柱子装回收集中,加入500ul Buffer RW1至柱子上,10000rpm离心60s;

(8)倒弃滤液,把柱子装回收集中,加入600ul Buffer RW2至柱子上,10000rpm离心60s;

(9)重复步骤8;

(10)弃掉滤液,把柱子重新装回收集管中,10000rpm离心2min;

(11)将柱子转移至1.5ml离心管中;

加入50ulRNase Free Water至柱子膜中央,室温静置2min,10000rpm离心1min;

(12)弃掉柱子,采用2%浓度的琼脂糖凝胶电泳检测RNA的完整性,以此判断RNA产量和质量。

3.根据权利要求2所述的CsTTG1基因与茶叶茸毛生长发育线性关系的鉴定方法,其特征在于,所述HiPure RNA Mini Column的柱容量为1.5mL,洗脱体积为50-100uL。

4.根据权利要求2所述的CsTTG1基因与茶叶茸毛生长发育线性关系的鉴定方法,其特征在于,所述HiPure RNA Mini Column的柱容量为15mL,洗脱体积为0.3-0.6mL。

5.根据权利要求1所述的CsTTG1基因与茶叶茸毛生长发育线性关系的鉴定方法,其特征在于,步骤S3中,所述RNA序列分别反转录成cDNA的方法,包含以下步骤:

(1)基因组DNA去除,在RNase free 的离心管中配置如下混合液4 x gDNA wipe Mix1-4ul;模板RNA 1-4ul;RNase free ddH2O 2-7ul;用移液枪轻轻吹打混匀,放于水浴锅中水浴38-50℃ 1-4min;

(2)配置逆反转录反应体系,在以上体系中加入5x HiScript ║ qRT SuperMix║ 1-4ul,用移液枪轻轻吹打混匀;

(3)进行逆转录反应,15-30℃ 7-15min,40-60℃ 22-42min,72-90℃ 3-8min。

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