[发明专利]基于DNA-银纳米簇变构探针的转录因子荧光检测方法有效
申请号: | 201810909469.5 | 申请日: | 2018-08-10 |
公开(公告)号: | CN109207561B | 公开(公告)日: | 2021-10-22 |
发明(设计)人: | 周学敏;李昺之;陈月;王晶;卢巧云;洪俊丽;朱婉莹 | 申请(专利权)人: | 南京医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6816 | 分类号: | C12Q1/6816 |
代理公司: | 北京思创大成知识产权代理有限公司 11614 | 代理人: | 尹慧晶 |
地址: | 210029 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 dna 纳米 簇变构 探针 转录 因子 荧光 检测 方法 | ||
1.一种基于DNA-银纳米簇变构探针的转录因子荧光检测方法,其特征在于,该检测方法包括如下步骤:
a)以发卡状DNA为模板,加入硝酸银、硼氢化钠,使其原位还原生成DNA-银纳米簇变构探针AgSwitch;发卡状DNA中含有G增强序列,变构探针AgSwitch中的DNA-银纳米簇与所述G增强序列的距离变化使得体系荧光发生变化;
b)将多个不同浓度的转录因子溶液与步骤a)得到的AgSwitch孵育反应,所述转录因子能够与变构探针AgSwitch特异性结合;
c)测定体系的荧光值,获得转录因子浓度与荧光强度的线性关系,绘制标准曲线;
d)在与步骤c)同样的条件下测定待测样品的荧光强度,根据步骤c)的标准曲线,得到待测样品中转录因子的浓度;
其中,所述发卡状DNA选自以下序列中的一种;
AgSwitch-p50的模板序列,其具有如SEQ ID NO:1所示的碱基序列,可与转录因子p50特异性结合;
AgSwitch-TBP的模板序列,其具有如SEQ ID NO:2所示的碱基序列,可与转录因子TBP特异性结合;
AgSwitch-MITF的模板序列,其具有如SEQ ID NO:3所示的碱基序列,可与转录因子MITF特异性结合。
2.根据权利要求1所述的基于DNA-银纳米簇变构探针的转录因子荧光检测方法,其特征在于,步骤a)中,所述DNA-银纳米簇变构探针AgSwitch通过以下步骤制备得到:将1 OD的发卡状DNA模板溶解于900 μL缓冲液 中,加热至90℃,维持15 min后阶梯降温至37℃,降温持续时间为45 min,随后加入15 μL,10 mM新制硝酸银溶液,涡旋混合后避光在冰水混合物中反应30 min,接着,迅速加入20 μL,10 mM新制硼氢化钠溶液,在涡旋混合仪上剧烈涡旋30s,沉浸入冰水混合物中10s,再涡旋30s,反复至少三次,然后避光在冰水混合物中反应过夜;所述缓冲液 为柠檬酸盐缓冲液。
3.根据权利要求2所述的基于DNA-银纳米簇变构探针的转录因子荧光检测方法,其特征在于,所述硼氢化钠溶液用冰水配制。
4.根据权利要求1所述的基于DNA-银纳米簇变构探针的转录因子荧光检测方法,其特征在于,步骤b)中,所述孵育在结合缓冲液中进行,所述结合缓冲液的配方为:10 mMNa2HPO4/NaH2PO4,100 mM CH3COONa,10 mM Mg(CH3COOH)2,15%甘油,0.08 mg/mL poly(dI-dC),pH=7.4。
5.根据权利要求4所述的基于DNA-银纳米簇变构探针的转录因子荧光检测方法,其特征在于,步骤b)中,多个不同浓度的转录因子溶液由转录因子的母液稀释制得,所述稀释液为结合缓冲液。
6.根据权利要求5所述的基于DNA-银纳米簇变构探针的转录因子荧光检测方法,其特征在于,多个不同浓度的转录因子溶液的浓度为0.5 nM-1.25 μM。
7.根据权利要求6所述的基于DNA-银纳米簇变构探针的转录因子荧光检测方法,其特征在于,步骤b)的孵育反应体系中,结合缓冲液、转录因子溶液与AgSwitch溶液的体积比为40-50:4-6:1;AgSwitch溶液的浓度为4.5-5.5 μM;孵育反应在37 ℃下进行1 h。
8.根据权利要求1所述的基于DNA-银纳米簇变构探针的转录因子荧光检测方法,其特征在于,步骤c)包括:将孵育反应后所得样品离心,然后装入石英比色皿进行荧光检测,荧光检测条件包括:激发波长为561 nm,扫描速度为1000 nm/min,光电倍增管电压为800 V,激发狭缝和发射狭缝宽度为5 nm。
9.根据权利要求1所述的基于DNA-银纳米簇变构探针的转录因子荧光检测方法,其特征在于,所述待测样品为从实际细胞或组织样品中获得的核蛋白提取物。
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