[发明专利]用于检测rs12041331的引物探针组及其应用

说明书

本发明公开了一种用于检测rs12041331的引物探针组及其应用。本发明首先保护一种引物探针组，由引物F、引物R和探针P组成；引物F为序列表的序列1所示的单链DNA分子；引物R为序列表的序列2所示的单链DNA分子；探针P为一个末端具有荧光基团且另一个末端具有荧光淬灭基团的单链DNA分子，且DNA分子中的部分核苷酸为锁核酸，DNA分子的核苷酸序列为序列表的序列3所示。本发明可用于检测rs12041331，判断待测样本基于该位点的基因型，从而指导用药，具有重大的应用推广价值。

技术领域

本发明涉及一种用于检测rs12041331的引物探针组及其应用。

背景技术

PEAR1基因是近年发现的调控血小板功能的重要基因，在血小板和内皮细胞中高度表达，它的磷酸化作用可促进血小板的聚集。人的PEAR1基因定位于1q23.1，约30kbp，包括23个外显子和22个内含子；其编码的蛋白是一种具有多表皮生长因子类似物区域的横跨膜1型蛋白，该蛋白是细胞外蛋白质相互作用区域的组成部分，胞外部分有15个表皮生长因子样重复单元，具有多个酪氨酸和脯氨酸，胞内的区域结构包括5个脯氨酸区域和一个NPXY922区域，均为磷酸化酪氨酸的结合点。

rs12041331是位于 PEAR1基因中的一个SNP，存在两种多态形式，G/A，G为野生型，A为突变型，人群中存在三种基因型，分别为GG,GA,AA，其多态性与PEAR1蛋白表达量显著相关。

氯吡格雷和阿司匹林是临床上常用的抗血小板聚集药物，二者联合应用是经皮冠状动脉介入治疗（Percutaneous coronary intervention，简称PCI）术后患者抗血小板聚集治疗最常用的给药方案。然而，部分PCI术后患者按照常规剂量服用氯吡格雷联合阿司匹林抗血小板治疗效果不佳，其原因可能与患者自身肝脏中的药物代谢酶基因多态性有关。研究发现，PEAR1基因多态性与阿司匹林疗效最相关，突变携带者则心血管不良事件发生的概率显著增加。PEAR1基因可调控PI3K/PTEN（phosphatidylinositol 3 kinase，磷脂酰肌醇3激酶，pentaerythritol tetranitrate四硝酸戊赤藓醇）通路，影响血小板的功能。PEAR1基因具有激活血小板、降低巨核祖细胞（血小板祖细胞）的增殖、影响血小板的聚集反应等功能，与冠心病和粘血症等疾病相关联。因此，PEAR1基因多态性将会导致阿司匹林抗血小板治疗效果出现显著的个体化差异。GG等位基因对阿司匹林抗血小板效果应答较好；GA/AA基因型，用阿司匹林（或结合氯吡格雷），PCI患者，心梗和死亡率较高。PEAR1 AA和AG基因型者，标准治疗，心梗和死亡风险是GG基因型的2.03~3.97倍。

发明内容

本发明的目的是提供一种用于检测rs12041331的引物探针组及其应用。

本发明首先保护一种引物探针组，由引物F、引物R和探针P组成；

引物F为如下（a1）或（a2）：

（a1）序列表的序列1所示的单链DNA分子；

（a2）将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子；

引物R为如下（b1）或（b2）：

（b1）序列表的序列2所示的单链DNA分子；

（b2）将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子；

探针P为一个末端具有荧光基团且另一个末端具有荧光淬灭基团的单链DNA分子，且DNA分子中的部分核苷酸为锁核酸，DNA分子的核苷酸序列为如下（c1）或（c2）：

（c1）序列表的序列3所示；

（c2）将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加。