[发明专利]一种捕获基因组特定DNA片段的方法在审
申请号: | 201810957663.0 | 申请日: | 2018-08-22 |
公开(公告)号: | CN109182454A | 公开(公告)日: | 2019-01-11 |
发明(设计)人: | 王珺 | 申请(专利权)人: | 杭州恺思医疗器械有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 杭州千克知识产权代理有限公司 33246 | 代理人: | 黎双华 |
地址: | 310031 浙江省杭州市西*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 捕获 基因组 蛋白复合物 测序文库 检测结果 目标区域 杂交富集 目标DNA 区域DNA 目标位 测序 构建 切割 杂交 基因 检测 | ||
1.一种捕获基因组特定DNA片段的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)待检DNA与含有特定片段sgRNA探针/基因编辑蛋白复合物结合,温浴切割DNA;
(2)特定片段DNA构建测序文库;
(3)通过测序确定特定片段DNA序列。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的sgRNA探针为基因编辑蛋白识别特定片段所需的探针,探针序列与特定片段互补,特定片段是一个或是多个靶标,每一个特定片段至少需要前后两个探针,中间间隔距离根据后期的检测要求调整。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,sgRNA探针/基因编辑蛋白复合物结合DNA后,37℃温浴30分钟,实现特定片段DNA切割。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括通过清洗、过柱去除非特定片段DNA的步骤。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,构建测序文库的方法是:切割下来的DNA,通过T4 DNA聚合酶、Klenowexo-、T4 DNA磷酸激酶(T4 DNA PNK)、Taq聚合酶或Klenow酶中的一种或多种补平和增加碱基A,37℃反应20分钟;加入细菌碱性磷酸酶(BAP)1分钟后,75℃变性5~10分钟,待温度降低后加入DNA连接酶、DNA接头,20℃连接20分钟;纯化去除反应体系中的蛋白和缓冲液,构建DNA测序文库,直接用于后续检测;若测序文库浓度过低,通过PCR方法扩增富集。
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