[发明专利]基于图像构建测序模板的方法、装置和计算机产品

权利要求书

1.一种基于图像构建测序模板的方法，其特征在于，所述图像包括分别对应A、T/U、G和C四种类型碱基延伸反应时的一个相同视野的第一图像、第二图像、第三图像和第四图像，碱基延伸反应时的该视野具有多个带有光学可检测标记的核酸分子，至少一部分所述核酸分子在所述图像上表现为亮斑，所述第一图像包括图像M1和图像M2，所述第二图像包括图像N1和图像N2，所述第三图像包括图像P1和图像P2，所述第四图像包括图像Q1和图像Q2，定义顺序或同时实现一次四种类型碱基延伸反应为一轮测序反应，

图像M1和图像M2分别来自两轮测序反应，图像N1和图像N2分别来自两轮测序反应，图像P1和图像P2分别来自两轮测序反应，图像Q1和图像Q2分别来自两轮测序反应，所述方法包括：

合并所述第一图像、第二图像、第三图像和第四图像上的亮斑，记录相同位置上的亮斑的数目，去除数目为1的亮斑，以获得对应所述测序模板的亮斑集合。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述合并所述第一图像、第二图像、第三图像和第四图像上的亮斑，包括：

(a)合并图像N1上的亮斑至图像M1中，获得一次合并图像M1，对于一次合并图像M1中的重合亮斑依据重合亮斑包含的亮斑的数目进行计数标记，对于非重合亮斑记为1，在所述一次合并图像M1中的距离小于第一预定像素的多个亮斑为一个所述重合亮斑；

(b)以图像P1、图像Q1、图像M2、图像N2、图像P2或图像Q2替代所述图像N1，以一次合并图像M1替代所述图像M1，多次进行(a)直至完成所有图像上的亮斑的合并，获得原始亮斑集合；

(c)去除所述原始亮斑集合中的标记为1的亮斑，以获得对应所述测序模板的亮斑集合。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述图像为经过配准的图像。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，配准所述图像，包括：

基于参考图像对待配准图像进行第一配准，所述参考图像和所述待配准图像对应相同视野，包括，

确定所述待配准图像上的预定区域和所述参考图像上的相应预定区域的第一偏移量，基于所述第一偏移量移动所述待配准图像上的所有亮斑，获得第一配准后的待配准图像；

基于所述参考图像对第一配准后的待配准图像进行第二配准，包括，

合并所述第一配准后的待配准图像和所述参考图像，获得合并图像，

计算所述合并图像上的预定区域的所有第二重合亮斑的偏移量，以确定第二偏移量，在所述合并图像上的距离小于第二预定像素的多个亮斑为一个所述第二重合亮斑，

基于该第二偏移量移动所述第一配准后的待配准图像上的所有亮斑，以实现对所述待配准图像的配准。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述参考图像通过构建获得，构建所述参考图像包括：

获取第五图像和第六图像，所述第五图像和所述第六图像与所述待配准图像对应相同视野；

基于第五图像对第六图像进行粗配准，包括确定所述第六图像和所述第五图像的偏移量，基于该偏移量移动所述第六图像，获得粗配准后的第六图像；

合并所述第五图像和粗配准后的第六图像，以获得所述参考图像。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，构建所述参考图像还包括利用第七图像和第八图像，所述待配准图像、第五图像、第六图像、第七图像和第八图像来自测序反应的相同视野，所述第五图像、第六图像、第七图像和第八图像分别对应A、T/U、G和C四种类型碱基延伸反应时的所述视野，构建所述参考图像还包括：

基于第五图像对第七图像进行粗配准，包括确定所述第七图像和所述第五图像的偏移量，基于该偏移量移动所述第七图像，获得粗配准后的第七图像；

基于第五图像对第八图像进行粗配准，包括确定所述第八图像和所述第五图像的偏移量，基于该偏移量移动所述第八图像，获得粗配准后的第八图像；

合并所述第五图像和粗配准后的第六图像、粗配准后的第七图像以及粗配准后的第八图像，以获得所述参考图像。

7.根据权利要求4-6任一项所述的方法，其特征在于，所述参考图像和所述待配准图像为二值化图像。