[发明专利]可用于肠癌液体活检的DNA甲基化标志物及其检测方法，引物对及试剂盒在审
| 申请号： | 201810971220.7 | 申请日： | 2018-08-24 |
| 公开（公告）号： | CN109097472A | 公开（公告）日： | 2018-12-28 |
| 发明（设计）人： | 王小平;宁争志 | 申请（专利权）人： | 深圳市天元印科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 深圳市世纪恒程知识产权代理事务所 44287 | 代理人： | 胡海国;关向兰 |
| 地址： | 518000 广东省深圳市南山区*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 肠癌 标志物 试剂盒 可用 引物 检测 标志物检测 位点 评估 应用 | ||
1.一种可用于肠癌液体活检的DNA甲基化标志物，其特征在于，所述DNA甲基化标志物是SHOX2基因中chr3:157821233-157821604位之间的CpG位点，所述DNA甲基化标记物的甲基化程度指示受试者肠癌发生的情况。
2.如权利要求1所述的可用于肠癌液体活检的DNA甲基化标志物，其特征在于，所述DNA甲基化标志物是SHOX2基因中chr3:157821303-157821353位之间的CpG位点。
3.如权利要求1所述的可用于肠癌液体活检的DNA甲基化标志物，其特征在于，所述DNA甲基化标志物的甲基化程度为检测阈值，待测受试者的CpG位点的甲基化程度高于和低于检测阈值时，分别检测待测受试者为正常和为肠癌发生风险；
所述DNA甲基化标志物选自SHOX2基因中chr3:157821233-157821604中的CpG位点发生甲基化，所述甲基化程度的检测阈值M＝(a1×X1+a2×X2+……+a11×X11)/(X1+X2+……+X11)，a1为0.04-0.1；a2为0.011-0.016；a3为0.08-0.16；a4为0.065-0.12；a5为0.11-0.3；a6为0.15-0.4；a7为0.13-0.28；a8为0.04-0.14；a9为0.11-0.16；a10为0.1-0.17；a11为0.01-0.4；X1、X2、……、X11为0或1；
或者所述甲基化程度的检测阈值M＝(a1×X1+a2×X2+……+a5×X5)/(X1+X2+……+X5)，a1为0.065-0.12；a2为0.11-0.3；a3为0.15-0.4；a4为0.13-0.28；a5为0.04-0.14；X1、X2、……、X5为0或1。
4.如权利要求3所述的可用于肠癌液体活检的DNA甲基化标志物，其特征在于，所述DNA甲基化标志物选自SHOX2基因中chr3:157821233-157821604中如下位置起始的CpG位点的DNA甲基化：50、60、68、86、106、116、120、126、223、227和235。
5.一种用于检测权利要求1至4中任一项所述的DNA甲基化标志物的引物对，其特征在于，所述引物对扩增含有所述DNA甲基化标志物的一段序列。
6.如权利要求5所述的引物对，其特征在于，所述引物对选自：SEQ ID NO.2和SEQ IDNO.3；SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5；SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.7的其中之一。
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