[发明专利]用于检测皮炎芽生菌的引物探针组及其应用在审

专利信息
申请号: 201810976402.3 申请日: 2018-08-25
公开(公告)号: CN108950053A 公开(公告)日: 2018-12-07
发明(设计)人: 赵海文;刘婷婷;李朋;丛茜 申请(专利权)人: 潍坊德诺泰克生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12R1/645
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 261000 山东省潍坊市滨海*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 皮炎芽生菌 引物探针 检测 样本 应用前景广阔 实时荧光PCR 特异性区域 特异性引物 基因组DNA 高度保守 快速检测 目标基因 相关信息 基因 靶基因 可用 扩增 探针 应用
【权利要求书】:

1.一种检测皮炎芽生菌的Real-time PCR特异性引物和探针,其特征在于,包括设计的引物F、引物R和探针P,所述的引物F、引物R和探针P分别是按下述碱基序列由DNA合成仪合成DNA片段,具体为:

引物F:5'- ATTCAAGACAACAGAGCC -3';

引物R:5'- GCAACTTGGATAATGCGT -3';

探针P:5'-FAM- CAGGCGAAATCGAGAATCGG -BHQ1-3'。

2.一种采用权利要求1所述的特异性引物和探针的皮炎芽生菌的Real-time PCR检测方法,其特征在于以下实验步骤:

(1)被检样本核酸提取:样本处理采用血液基因组DNA提取试剂盒(0.1-1ml)(天根生化科技有限公司,货号DP318)、细菌基因组DNA提取试剂盒(天根生化科技有限公司,货号DP302);

(2)以权利要求1中的特异性引物和探针进行Real-time PCR反应操作:12.5μL 2×Reaction Buffer、0.2μL Taq DNA聚合酶溶液(含0.6U Taq DNA聚合酶)、0.15μL dNTP溶液(dNTP溶液中含有dATP、dCTP和dGTP,dATP、dCTP和dGTP在dNTP溶液中的浓度均为33mmol/L)、0.1μL dUTP溶液(dUTP溶液中,dUTP的浓度为100mmol/L)、0.1μL UDG酶溶液(含0.12UUDG酶)、0.5μL引物F溶液、0.5μL引物R溶液、0.5μL探针P溶液、3μL步骤一得到的模板样本,加入ddH2O至25μL;

反应体系中,引物F的浓度为10μM,引物R的浓度为10μM,探针P的浓度为10μM;

混匀后稍离心在荧光定量PCR仪上进行Real-time PCR反应操作;

(3)pUC57-BAD1质粒Real-time PCR标准曲线制作:测定质粒D260nm值和D280nm,用D260nm/D280nm值为1.8~2.0的质粒用于制作标准曲线;

(4)检测犬全血样本中的皮炎芽生菌:运行本发明中的反应参数和反应体系,检测样本中含有皮炎芽生菌的BAD1基因,通过计算机分析软件得到Real-timePCR扩增曲线,与阳性对照的扩增曲线比对,判断是否存在皮炎芽生菌。

3.根据权利要求2所述的皮炎芽生菌的Real-time PCR检测方法,其特征在于,所述的反应参数为:50℃,2mins;预变性处理为95℃,10mins;变性处理,95℃,15s,退火/延伸/收集荧光信号处理,50℃,20s,72℃ 20s;反应操作40个循环。

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