[发明专利]一种氧化修饰的含氮碱基的检测方法

权利要求书

1.一种氧化修饰的含氮碱基的检测方法，其特征在于，测定不同含氮碱基的IPD值，根据IPD值的不同得到氧化修饰的含氮碱基。

2.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述含氮碱基包括腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶。

3.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述含氮碱基为鸟嘌呤，所述氧化修饰的含氮碱基为8-oxoG。

4.根据权利要求3所述的检测方法，其特征在于，所述IPD值为氧化修饰的含氮碱基的IPD值与相应的含氮碱基的IPD值的比值。

5.根据权利要求4所述的检测方法，其特征在于，所述比值大于1时为氧化修饰的含氮碱基；反之，则不是。

6.根据权利要求1-5任一项所述的检测方法，其特征在于，步骤如下：

将待检测物测序，得到的序列依次测定含氮碱基的IPD数值，得到第一列IPD数值；

将待检测物的序列按照未氧化的形式依次测定含氮碱基的IPD数值，得到第二列IPD数值；

相同位置上的所述第一列IPD数值与所述第二列IPD数值相比得到比值，根据比值的大小判断是否为氧化修饰的含氮碱基；

进一步地，所述氧化修饰的含氮碱基的位点的覆盖率达到25倍以上。

7.根据权利要求6所述的检测方法，其特征在于，所述测序采用SMRT测序技术进行。

8.根据权利要求6所述的检测方法，其特征在于，所述待检测物构建基因文库，纯化，平末端连接接头，结合测序引物和酶进行测序。

9.根据权利要求6所述的检测方法，其特征在于，所述测序在测序仪上进行，优选为PacBio RSII测序仪或PacBioSequel测序仪。

10.根据权利要求6所述的检测方法，其特征在于，在步骤根据比值的大小判断是否为氧化修饰的含氮碱基中，氧化修饰的含氮碱基的目标比值通过软件进行筛选，所述软件并给出氧化修饰的含氮碱基的位置。