[发明专利]生物信息分析工具的制作方法、装置及可存储介质

权利要求书

1.一种生物信息分析工具的制作方法，其特征在于，

所述方法包括：

解析一生物信息的分析流程，建立至少两个相互独立的分析步骤及任意所述分析步骤的实施次序；

根据所述分析步骤配置分析模块及所述分析模块的输入数据流、输出数据流及参数文件；

应用nextflow根据任意所述分析模块之间的实施次序建立一工作流程框架；

在所述工作流程框架内分别匹配不同分析模块的process；

根据所述分析步骤配置实施所述的process的nextflow脚本程序；

根据参数文件在所述process的config接口设置实施参数；

在所述process根据输入数据流配置input，根据输出数据流配置配置output，在实施次序相邻的两个process之间，配置在先次序的process的output与在后次序的process的input具有相同接口标准；

根据接口标准相同的input及output建立任意两个所述process之间的交互链接及执行顺序；

根据所述工作流程框架包括的所述process、所述process配置的执行程序及实施参数、任意所述process的交互连接及执行顺序制作所述生物信息分析工具。

2.如权利要求1所述的生物信息分析工具的制作方法，其特征在于，根据所述分析流程分别建立若干独立的所述实施次序。

3.如权利要求1所述的生物信息分析工具的制作方法，其特征在于，所述输入数据流至少包括原始数据、样本名称、接头信息及日志文件中的一种或多种。

4.如权利要求1所述的生物信息分析工具的制作方法，其特征在于，所述输出数据流至少包括输出路径和/或缓存路径。

5.如权利要求1所述的生物信息分析工具的制作方法，其特征在于，所述参数文件为存储在所述分析模块中config接口的建库类型、最小长度及滑动窗口尺寸中的一种或多种。

6.一种可存储介质，用于存储指令，其特征在于，所述指令被处理器执行时实现如权利要求1到5任意一项所述方法的步骤。

7.一种生物信息分析工具的制作装置，其特征在于，

所述装置包括：

解析模块，解析一生物信息的分析流程，建立至少两个相互独立的分析步骤及任意所述分析步骤的实施次序；根据所述分析步骤配置分析模块及所述分析模块的输入数据流、输出数据流及参数文件；

制作模块，应用nextflow根据任意所述分析模块之间的实施次序建立一工作流程框架；在所述工作流程框架内分别匹配不同分析模块的process；根据所述分析步骤配置实施所述的process的nextflow脚本程序；根据参数文件在所述process的config接口设置实施参数；在所述process根据输入数据流配置input，根据输出数据流配置配置output，在实施次序相邻的两个process之间，配置在先次序的process的output与在后次序的process的input具有相同接口标准；根据接口标准相同的input及output建立任意两个所述process之间的交互链接及执行顺序；

封装模块，根据所述工作流程框架包括的所述process、所述process配置的执行程序及实施参数、任意所述process的交互连接及执行顺序制作所述生物信息分析工具。