[发明专利]一种与菠菜果实形态相关的KASP分子标记及检测引物与应用

说明书

本发明属于分子遗传育种技术领域，具体公开了一种与菠菜果实形态相关的KASP分子标记及检测引物与应用。所述分子标记位于菠菜全基因组的Chr3：54314034，其位点存在等位基因C/T，与菠菜果实表面是否有刺相关。本发明基于KASP技术，根据关键突变位点[C/T]设计引物，用于鉴定菠菜果实形态。该技术可以高通量检测多个样本，大大提高检测效率，减少时间和成本，缩短菠菜雌性系的选育时间，提高育种效率。

技术领域

本发明属于分子遗传育种技术领域，具体地说，涉及一种与菠菜果实形态相关的KASP分子标记及检测引物与应用。

背景技术

菠菜(Spinacia oleracea L.)，别名波斯草、赤根菜，黎科菠菜属，二倍体(2n＝12)雌雄异株植物，栽培历史悠久，是我国重要的蔬菜作物之一。菠菜营养丰富，抗寒性强，适应性广，生产周期短，复种指数高，产量产值高，深受生产者和消费者欢迎。

菠菜生产中播种用的“种子”实为果实，果实形态是其重要的农艺性状之一,可分为有刺型和无刺型两种。有刺型菠菜的花萼发育成角状突起，俗称“刺”，一般为2～3个刺，少数为1个或4～6个刺，而无刺型菠菜的花萼不发育成角状突起(图1)。菠菜果实表面的刺由花萼发育而来，这也就决定了果实刺的有无由母本的基因型决定(即F₁“种子”形态是由母本的基因型决定)。Sneep(1958)通过大量的菠菜杂交组合发现，果实形态受单基因调控，其中有刺型对无刺型表现为显性性状。

目前，菠菜杂交种的生产主要采用以无刺型雌性系菠菜为母本，以有刺型自交系菠菜为父本进行杂交种的生产，这种生产方式不仅能够发挥菠菜杂种优势的特点，而且有利于且便于种子贮存、包装、运输、生产播种等操作(Sneep,1958)。菠菜为雌雄异株作物，果实形态受母本基因型控制，雄株携带的果实形态基因型只有在下一代采种时才能表现，因此在菠菜优良种质创新过程中，果实形态不易稳定纯化，给优良种质的纯化及品种选育造成了很大影响。

近年来，国内外对菠菜标记研究主要集中在菠菜性型及菠菜抗霜霉病研究上，开发了大量与其相关的分子标记。然而，至今为止未见果实形态相关分子标记的报道，严重影响了菠菜自交系的纯化速度和品种选育的进程。

发明内容

为了解决现有技术中存在的问题，本发明的目的是提供与菠菜果实形态相关的KASP分子标记及检测引物与应用

为了实现本发明目的，本发明的技术方案如下：

本发明首先提供一种与菠菜果实形态相关的分子标记，该分子标记为与菠菜果实形态紧密连锁的KASP(Kompetitive Allele Specific PCR)标记KM1112035，可用于检测菠菜果实表面是否有刺。

该分子标记信息如表1所示。

表1