[发明专利]基于NGS的突变基因的分析装置、设备及存储介质在审
申请号: | 201811013831.7 | 申请日: | 2018-08-31 |
公开(公告)号: | CN109243534A | 公开(公告)日: | 2019-01-18 |
发明(设计)人: | 张暋;谷晓辉;秦建平;佘维;韩雪莹;朱丽蒙;蔡田;刘玉霞;丁利霞 | 申请(专利权)人: | 郑州金域临床检验中心有限公司 |
主分类号: | G16B25/10 | 分类号: | G16B25/10;G16B50/00 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 罗满 |
地址: | 450006 河南省郑州市河南自贸试*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 突变基因 分析装置 样本数据 突变 存储介质 分析模块 获取模块 检索模块 突变数据 分析 多个数据库 分析设备 分析效率 目标网站 网络爬虫 预先建立 再利用 比对 时长 检索 数据库 自动化 查找 申请 | ||
1.一种基于NGS的突变基因的分析装置,其特征在于,包括:
获取模块,用于获取与突变基因对应的突变样本数据;
检索模块,用于根据所述突变样本数据,利用预先建立的网络爬虫在目标网站数据库中检索与所述突变样本数据对应的突变信息;
分析模块,用于对所述突变信息进行分析并生成分析报告。
2.根据权利要求1所述的基于NGS的突变基因的分析装置,其特征在于,所述获取模块具体包括:
第一获取单元,用于从生物信息分析系统中获取初始样本数据;
第一筛选单元,用于对所述初始样本数据进行靶向筛选以去除所述初始样本数据中的多态性基因突变位点;
第二筛选单元,用于对去除所述多态性基因突变位点中的初始样本数据进行突变检出以确定所述突变样本数据。
3.根据权利要求1所述的基于NGS的突变基因的分析装置,其特征在于,所述检索模块具体包括:
第一确定单元,用于确定所述突变样本数据中字段标识;
检索单元,用于根据所述字段标识,利用所述网络爬虫在目标网站数据库中检索与所述字段标识对应的突变信息。
4.根据权利要求3所述的基于NGS的突变基因的分析装置,其特征在于,还包括:
判断模块,用于判断所述突变样本数据中的字段标识的类型;
若确定所述突变样本数据中的字段标识的类型为与生物信息分析系统对应的第一类型,则进入确定模块;
所述确定模块,用于从预先确定的与所述第一类型对应的数据库中确定突变信息;
若所述突变样本数据中的字段标识的类型为与所述生物信息分析系统对应的第二类型,则进入所述检索模块。
5.根据权利要求3或4所述的基于NGS的突变基因的分析装置,其特征在于,所述检索单元中的目标网站数据库具体包括:NCBI网站数据库和COSMIC网站数据库。
6.根据权利要求1-4任意一项所述的基于NGS的突变基因的分析装置,其特征在于,若所述检索模块未从所述目标网站数据库中检索到与所述突变样本数据对应的突变信息,还包括:
查找模块,用于利用所述网络爬虫在联合知识库中查找与所述突变样本数据对应的突变信息。
7.一种基于NGS的突变基因的分析设备,其特征在于,包括:
存储器,用于存储分析程序;
处理器,用于执行所述存储器中存储的分析程序时执行以下步骤:
获取与突变基因对应的突变样本数据;
根据所述突变样本数据,利用预先建立的网络爬虫在目标网站数据库中检索与所述突变样本数据对应的突变信息;
对所述突变信息进行分析并生成分析报告。
8.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质上存储有分析程序,所述分析程序被处理器执行以下步骤:
获取与突变基因对应的突变样本数据;
根据所述突变样本数据,利用预先建立的网络爬虫在目标网站数据库中检索与所述突变样本数据对应的突变信息;
对所述突变信息进行分析并生成分析报告。
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