[发明专利]一种通过函数拟合确定DNA片段临界聚乙二醇浓度的系统及方法在审

专利信息
申请号: 201811036503.9 申请日: 2018-09-07
公开(公告)号: CN109022268A 公开(公告)日: 2018-12-18
发明(设计)人: 柏锦程;张振 申请(专利权)人: 南京微略生物科技有限公司
主分类号: C12M1/38 分类号: C12M1/38;C12M1/36;C12M1/34;C12M1/00;C12N15/10
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 210000 江苏省南京市霞区仙林街*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 聚乙二醇 函数拟合 控制模块 紫外分光光度计 自动化水平 磁分离架 多组数据 含磁颗粒 函数关系 凝胶电泳 曲线拟合 数据来源 数据信息 运行参数 自动能力 磁颗粒 干燥箱 离心管 容器箱 真空泵 震荡仪 节约 涡旋 羧基 耗时 直观 应用
【说明书】:

本发明专利公布了通过函数拟合确定DNA片段临界聚乙二醇浓度的系统及方法,装置包括:控制模块、PCR扩增仪、容器箱、涡旋震荡仪、磁分离架、真空泵、干燥箱、紫外分光光度计、若干羧基磁颗粒、2根离心管。本发明避免了凝胶电泳的过程,节约时间,通过控制模块设定各个仪器的运行参数并接受数据信息,节约人力和时间,具备一定自动化水平,通过多次改变聚乙二醇浓度获得多组数据,数据来源更为真实可靠,通过曲线拟合得到函数关系,定量直观有效,更为准确,提供一种拥有一定自动能力、可应用于含磁颗粒DNA溶液、耗时较少、操作简便、精度更高的通过函数拟合确定DNA片段临界聚乙二醇浓度的系统及方法。

技术领域

本发明涉及微量DNA提取领域,尤其涉及通过函数拟合确定DNA片段临界聚乙二醇浓度的系统及方法。

背景技术

DNA分子的提取及其样品的制备在分子生物医学中具有重要作用,尤其是在相关的医学研究中,更是必不可少的前提条件,而微量DNA提取对于一些疾病的分子诊断和微生物的分子检测具有重要作用,其提取的高效性直接影响着诊断与检测的灵敏度

目前,为了进行快速且高效的DNA提取,利用不同聚乙二醇(PEG)浓度下不同长度的DNA片段会形成不同沉淀,并在沉淀后在碱基和羧基的相互作用下吸附结合到磁颗粒表面上去,而在离子浓度较低的溶液中这种吸附又会逐渐接触,从磁颗粒的表面脱附下来,由此完成DNA的微量提取的原理,以羧基修饰的磁颗粒作为载体,在聚乙二醇(PEG)和盐的共同作用下,进行微量DNA的可逆吸附与脱附,以此实现核酸DNA的分离和纯化。

采用聚乙二醇与羧基磁性颗粒结合提取微量DNA的方法与传统的凝胶电泳DNA提取法相比,聚乙二醇与羧基磁性颗粒结合提取微量DNA的方法在DNA的沉淀分离方面更为快速且有效,操作简单,且在高通量自动化的操作平台也很适用。

虽然聚乙二醇与羧基磁性颗粒结合提取微量DNA的方法具备明显的优势,但也存在一些问题,其中最为主要的问题是聚乙二醇的浓度选择,不同的聚乙二醇浓度不仅可使得相应的DNA片段发生沉淀,其沉淀速度也收到浓度的影响,使得所要提取的目标DNA片段发生最快速沉淀的聚乙二醇浓度即为临界聚乙二醇浓度。

以前研究临界聚乙二醇浓度的方法有:沉淀法、荧光影像法、粘度测定法、动态光散射法等,但这些方法不能在含有磁颗粒的DNA溶液中使用,因此不适用于聚乙二醇与羧基磁性颗粒结合提取微量DNA的方法,现有的凝胶电泳法虽可确定临界聚乙二醇浓度,但其凝胶电泳过程耗时比较长,且需要认为判断,得出的临界聚乙二醇浓度并不精确,因此目前需要一种可靠有效的方法来确定聚乙二醇与羧基磁性颗粒结合提取微量DNA片段的临界聚乙二醇浓度。

发明内容

本发明的目的是解决微量DNA片段提取过程中临界聚乙二醇浓度难以确定问题,提供一种可应用于含磁颗粒DNA溶液、耗时较少、操作简便、精度更高的通过函数拟合确定DNA片段临界聚乙二醇浓度的系统及方法。

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