[发明专利]构建多sgRNA表达载体的方法在审
申请号: | 201811054251.2 | 申请日: | 2018-09-11 |
公开(公告)号: | CN110885853A | 公开(公告)日: | 2020-03-17 |
发明(设计)人: | 褚贝贝;杨国宇;王江;刘忠虎;汪新建;钟凯;鲁维飞;郭豫杰 | 申请(专利权)人: | 河南农业大学 |
主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85;C12N5/10;C12N15/66 |
代理公司: | 北京永新同创知识产权代理有限公司 11376 | 代理人: | 程大军;栾星明 |
地址: | 450002*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 构建 sgrna 表达 载体 方法 | ||
1.一种构建包含串联的靶向不同基因组位点的N个sgRNA编码序列的表达载体的方法,其包括以下步骤:
1)提供如下的N-1个DNA片段:
第1个片段:G1-S-P-G2;……第N-1个片段:GN-1-S-P-GN,
其中G1,……GN代表N个分别靶向不同基因组位点的sgRNA向导序列,S代表sgRNA的框架序列,P代表驱动sgRNA表达的启动子,N是选自2-10的整数,
其中所述第1个片段的5′端还包含所述驱动sgRNA表达的启动子P或其部分序列,所述第N-1个片段的3′端还包含所述sgRNA的框架序列S或其部分序列;
2)提供线性化的表达载体,其中所述线性化的表达载体的一端具有所述驱动sgRNA表达的启动子P或其部分序列,另一端具有所述sgRNA的框架序列S或其部分序列;
3)将所述N-1个片段与所述线性化的表达载体混合,在合适的条件下进行同源重组,
由此产生包含串联的靶向不同基因组位点的N个sgRNA编码序列的表达载体。
2.权利要求1的方法,其中所述线性化的表达载体的一端具有所述驱动sgRNA表达的启动子P的部分序列与第1个片段的5′端的所述驱动sgRNA表达的启动子P的部分序列重叠,从而能进行同源重组。
3.权利要求1的方法,其中所述线性化的表达载体的一端的所述sgRNA的框架序列S的部分序列与第1个片段的3′端的所述sgRNA的框架序列S的部分序列重叠,从而能进行同源重组。
4.权利要求1的方法,其中所述N-1个DNA片段可以通过PCR扩增得到或可以直接化学合成获得。
5.权利要求1的方法,其中所述线性化的表达载体还含有另一启动子,以及与所述另一启动子可操作地连接的编码CRISPR核酸酶的多核苷酸。
6.权利要求5的方法,其中任选地,所述编码CRISPR核酸酶的多核苷酸还与调控基因表达的其他元件可操作地连接,例如终止子等。
7.权利要求5的方法,其中所述另一启动子是RNA聚合酶II启动子,包括EF1α启动子、CMV启动子、CBA启动子、hSynapsin启动子、HSV-TK启动子、SV40早期启动子和LSP启动子,优选CMV启动子。
8.权利要求5的方法,其中所述CRISPR核酸酶是Cas9。
9.权利要求8的方法,其中所述Cas9为金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)Cas9或其变体。
10.权利要求1的方法,其中所述线性化的表达载体为线性化的质粒载体。
11.权利要求10的方法,其中所述质粒载体用于病毒载体如腺相关病毒(AAV)的包装。
12.权利要求10的方法,其中所述质粒载体衍生自pX601载体。
13.通过权利要求1-12的方法制备的包含串联的靶向不同基因组位点的N个sgRNA编码序列的表达载体。
14.权利要求13的表达载体,其中所述载体特别适合于在细胞中同时对多个基因组位点进行CRISPR介导的基因编辑。
15.一种试剂盒,其包含权利要求13-14的表达载体。
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